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革兰阴性菌耐药表型的宏基因组预测：现状、进展、机遇与挑战

抗菌药物耐药已成为全球公共卫生的重大挑战，革兰阴性菌因复杂的耐药机制其耐药问题尤为突出。宏基因组测序（mNGS）作为一种无需培养、可直接对临床样本进行高通量分析的技术，已在病原检测中广泛应用，并逐步用于耐药表型的预测。本文聚焦于mNGS技术在革兰阴性菌耐药性预测中的应用价值，系统梳理其在检测速度、广度、可重复利用性等方面的优势，分析当前面临的基因型与表型不一致、关键突变难以识别、基因组覆盖不足以及耐药基因物种归属不明等挑战。进一步介绍了当前研究中针对上述问题所提出的解决方案，包括机器学习方法、去宿主与富集策略、多策略归属分析等。本文旨在