斑马鱼介观脑图谱通用物理空间、介观脑图谱数据集元数据.pdfVIP

T/SSBIXXXX—XXXX

附录A

（规范性）

斑马鱼介观脑图谱通用物理空间

A.1基本信息

斑马鱼介观脑图谱通用物理空间（CommonPhysicalSpaceversion1，CPSv1）由本文件牵头起草

单位构建并公开发布，用作斑马鱼介观脑图谱数据集的统一参考空间与坐标体系。

CPSv1基于AdvancedNormalizationTools（ANTs）中的对称群组标准化算法，将16尾6dpf（days

postfertilization）双转基因斑马鱼Tg(elavl3:H2B-GCaMP6s);TgBAC(vglut2a:LOXP-DsRed-LOXP-GFP)活

体共聚焦三维扫描图像，经7轮平均模版构建迭代生成双通道参考模板。

CPSv1的核心参数如下：

a)基础双通道参考表达模式：

Tg(elavl3:H2B-GCaMP6s