微RNA靶点预测软件全解析.pptVIP

用于预测miRNA目标位点的工具

TargetScan

miRanda

PicTar

Microcosm

microT-ANN

miRDB

Mirgen;一、TargetScan介绍;TargetScan本地运行版本介绍;2)包括了所需基因3‘UTRs多重比对成果的tab-delimited文件

该文件包括了3列数据：

GenesymbolortranscriptID

Species/taxonomyID

Sequence;3、输出文件

包括如下13列数据：GeneID、miRNA_family_ID、species_ID、MSA_start、MSA_end、UTR_start、UTR_end、Group_ID、Site_type、miRNAinthisspecies、Group_type、Species_in_this_group、Species_in_this_group_with_this_site_type

实例如下：;TargetScan网页接口界面;TargetScan网页接口运行成果;在UCSC上显示TargetScan运行成果;二、miRandaTargetDetection介绍;miRandaTargetDetection本地运行版本介绍;miRandaTargetDetection本地运行成果实例;miRandaTarget