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单细胞测序在免疫学研究中的应用汇报人：免疫学研究团队

目录单细胞测序技术概述免疫细胞异质性研究免疫发育与分化轨迹疾病免疫图谱构建免疫治疗新策略技术挑战与未来展望010203040506

单细胞测序技术概述01

技术背景：为何需要单细胞分辨率掩盖异质性传统bulk测序的局限群体平均细胞群体表达特征单细胞分辨率突破性的技术能力高度异质性免疫细胞包含多种亚型功能状态差异显著动态变化免疫应答过程中细胞状态快速转换稀有细胞重要性关键免疫细胞可能仅占极小比例单细胞测序的核心价值：解析免疫细胞群体的组成、状态与功能，揭示群体测序无法发现的生物学规律

单细胞测序技术原理1单细胞分离流式细胞术、微流控芯片、激光捕获显微切割→2细胞裂解与RNA捕获利用poly(T)引物捕获mRNA的poly(A)尾→3逆转录与扩增将RNA逆转录为cDNA，通过PCR扩增获得足量文库→4高通量测序Illumina等平台进行深度测序微流控技术实现高通量单细胞捕获UMI分子标签消除扩增偏差

主流技术平台比较平台原理通量适用场景10xGenomics微流控油滴包裹500-10000细胞/样本大规模免疫图谱构建Smart-seq2板式反应96-384细胞/样本全长转录本、低丰度基因检测Drop-seq微流控油滴高通量成本敏感的大规模研究CITE-seq抗体-DNA偶联中高通量蛋白质与RNA联合检测微流控板式油滴抗体偶联