分子系统树法(复旦大学研究生课件).pptxVIP

分子系统树法复旦大学研究生课程·生物信息学与进化生物学

Contents课程大纲分子系统树法的理论基础、核心方法与前沿技术01系统发育学的历史与理论基础02分子系统学核心研究方法03分子系统树构建技术流程04序列比对与进化模型选择05构树算法原理与应用06系统树评估与前沿进展

CHAPTER01系统发育学的历史与理论基础从达尔文进化论到分子系统学的三次范式革命

Chapter01·理论基础达尔文进化论与系统发育学起源达尔文《物种起源》提出的带有修饰的下降理论与海克尔的系统树概念，共同奠定了系统发育学的理论基础，使生物分类学从形态描述迈向进化推演的科学范式。达尔文《物种起源》原始手稿，1859海克尔系统发育树插图，1866011859年《物种起源》提出自然选择驱动的进化论，首次系统阐述物种分化与共同祖先理论，为系统发育分析提供哲学基础1859021866年海克尔绘制首棵系统发育树，用树状图呈现生物类群间的谱系关系，开创图形化表达进化历史的先河186603早期系统学依赖形态学特征进行分类，通过比较解剖学、胚胎学等证据推断亲缘关系，但存在趋同进化导致的误判风险MORPHOLOGY

MolecularRevolution分子生物学革命与系统学范式转型DNA测序技术的突破使系统发育分析从形态比较进入分子层面，遗传信息的海量数据与客观性优势推动系统学进入精准量化时代，尤其解决了微