GEO数据库简介课件PPT.pptVIP

在GEODataSets中每个数据集组个体都各自确定一个实验,而在GEOProfiles中每个数据集组都对应多个表达谱个体。对平台上的每个基因（比如基因A)，有多个样本)测量值。多个相关样本构成一个数据集,从中可以产生单个或多个基因的表达谱比较图。从GEO数据库主页面右侧找到搜索栏，直接输入要查找信息的关键词或者检索词，如mir29a”或者GDS2225ANDfto”，就会搜索到相应的DataSets和Profiles。从主页面右侧直接打开库浏览器，从中按照不同的系列”、平台”、样本”、物种”、历史”来进行选择需要的数据类型。直接从GEO数据库的ftp服务器下载。/geo/直接从NCBI主页用Entrez进行检索。GEO数据主要存放在GEODataSets和GEOProfiles

两个数据库内。Entrez是NCBI建立的生物医学数据库集成检索系统。Entrez集成系统的最大特点是通过任何一个数据库检索出的信息可直接链接到Entrez其它数据库并找到相关的检索结果。GEO可和其他NCBI数据库一样用标准关键词的方法和基于文本布尔检索、基于序列检索、基于特有表达行为挖掘检索或结合这些参数来进行检索查询例如：在GEODataSets中可以用检索词prostatecancerANDhuman[Organism]”寻