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生物信息学基础分析指南

第一章基因序列比对算法原理与应用

1.1动态规划算法在序列比对中的应用

1.2局部与全局序列比对的实现差异

1.3BLAST算法的原理及其在生物信息学中的优势

1.4Smith-Waterman算法与Needleman-Wunsch算法的比较分析

第二章基因组组装技术及其优化策略

2.1deBruijn图在基因组组装中的应用

2.2基于SOAPdenovo的短读长序列组装方法

2.3长读长测序技术在基因组组装中的突破

2.4基因组组装质量控制与错误率评估

第三章基因表达数据分析与调控网络构建

3.1RNA-Seq数据预处理与标准化方法

3.2差异基因表达分析中的EdgeR与DESeq2方法

3.3基因调控网络构建与生物通路分析

3.4基因表达时序分析与动态变化模式

第四章蛋白质结构预测与功能位点识别

4.1同源建模技术在蛋白质结构预测中的应用

4.2基于物理化学性质的蛋白质结构预测方法

4.3蛋白质功能位点识别与结构域分析

4.4蛋白质相互作用预测与界面分析

第五章系统发育分析与进化树构建

5.1基于核苷酸序列的系统发育树构建方法

5.2基于蛋白质序列的进化关系分析

5.3贝叶斯系统发育分析及其应用

5.4系统发育树可视化与交互分析工具

第六章生物信息学数据库资源与检索策略

6.1NCBIGenBan