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基于图注意力的药物稳定性预测结题报告

一、研究背景与问题提出

药物稳定性是药物研发、生产及临床应用中的核心问题之一。据统计，约30%的药物研发失败案例与药物稳定性不足直接相关，而上市药物中因稳定性问题导致的召回事件每年给制药行业造成超过百亿美元的经济损失。传统的药物稳定性评估主要依赖于加速稳定性试验，通过在高温、高湿等极端条件下模拟药物降解过程，进而预测其在常规储存条件下的有效期。然而，这种方法存在周期长（通常需要6-12个月）、成本高、无法揭示降解机制等局限性，难以满足现代药物研发快速迭代的需求。

随着人工智能技术在药物研发领域的渗透，机器学习模型逐渐被应用于药物稳定性预测。早期的研究多采用分子指纹、描述符等一维或二维特征作为模型输入，结合随机森林、支持向量机等经典算法构建预测模型。但这类方法存在明显的缺陷：一方面，分子指纹等特征无法完整捕捉药物分子的三维空间结构信息，而药物的稳定性往往与分子内的空间相互作用密切相关；另一方面，传统机器学习模型缺乏对分子间复杂关联的建模能力，难以准确预测药物在不同配方、不同环境条件下的稳定性变化。

图神经网络（GNN）的出现为药物分子建模提供了新的思路。药物分子可以被自然地表示为图结构，其中原子作为节点，化学键作为边，图神经网络能够通过消息传递机制学习分子的局部和全局结构特征。然而，传统的图神经网络在处理分子图时，对所有相邻节点赋予相同的权重，忽