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基因组学
一.名词解释
1)稀有切点限制酶
在基因组范围内又较少的酶切识别位点的限制性酶,经酶切处理可以得到较大的片段。
2)重组热点(recombination hot spot)
染色体的某些位点之间比其他位点之间有更高的交换频率。
3)C值
指一个单倍体基因组中DNA的总量,一个特定的种属具有特定的C值。
4)辐射杂种群
含有另一种生物染色体片段的啮齿类细胞的集合体。
5)基因组
生物所具有的携带遗传信息的遗传物质总称。
6)可变剪切
指转录的mRNA前体的一种加工方式,通过不同外显子组合,使mRNA前体形成多种成熟的mRNA编码不同蛋白质,是形成蛋白质多样性的重要前提。
7)共线性
不同生物的基因组中基因排列顺序的一致性。
8)重叠群
由限制性内切酶技术或其他克隆方法获得大量DNA片段,根据DNA片段间片段间彼此重叠的序列构建的物理图谱。
9)RNA编辑
通过化学修饰改变转录物的编码性质,使其指令的蛋白质发生氨基酸顺序的变化,mRNA这类修饰
10)蛋白质组
由一个细胞或一个组织的基因组所表达的全部相应的蛋白质
11)遗传图谱
是以遗传距离表示基因组内座位相对位置的图谱。
12)comparative genomics
是基因组学与生物信息学的一个重要分支,通过模式生物基因组或模式生物基因组与人类组之间的比较与鉴别,为分离重要的候选基因,预测新的基因功能,研究生物进化提供依据。
13)链终止法
DNA测序最常用的方法,通过合成与单链DNA互补的多核苷酸链来读取待测DNA分子的顺序,在合成的互补单链过程中由于加入少量的双脱氧核苷酸(ddNTP)可在不同位置终止终止反应,形成仅有一个碱基差异的DNA复制链,通过电泳可读出DNA碱基顺序。
14)CpG岛
人类基因组中某些DNA区段的CG比例显著高于基因组平均水平,CpG岛的长度约1kb。
15)共分离
在有性繁殖的后代中,分子标记与连锁的基因有最大的可能同时出现在同一个体中,这一现象被称为共分离。
二、回答问题
1.新基因产生的途径有哪些?
a)部分或全部现有的基因加倍
b)基因重排
c)从其他物种获取基因
d)基因突变
2.为什么水稻能成为禾本科植物基因组研究的模式生物?
a)重要的粮食作物
b)基因组小,重复序列比例相对低;禾本科植物分子生物学的模式材料。
c)遗传转化系统已成熟,能大规模进行基因功能分析
d)禾本科植物基因组存在共线性
3.高等生物基因组甲基化具有那些生命学功能?
a)调控基因表达
b)引起表观(后生)遗传
c)抑制转座因子
d)染色体重建
e)基因组印记
4.为什么说蛋白质组比基因组更复杂?
1)基因组由4种核苷酸组成,而蛋白质由20种氨基酸组成。
2)基因组是相对稳定的实体,蛋白质通过与基因组的相互作用而不断发生变化,不同组织/发育时期存在差异
3)DNA到蛋白质的信息流,许多环节受到调控,如mRNA就、可变剪切、编辑,一个基因并不对应一种蛋白质;
4)蛋白质由有许多修饰方式,如磷酸化,糖基化等200多种;
5)蛋白质行使生物学功能,具备一定立体结构,存在蛋白质互作;
6)蛋白质承担更多的生物学功能。
5.基因组时代基因的定义是什么?判断一段DNA序列是否包含基因有哪些标准?
Gene:a complete chromosomal segment resposible for making a functional product.
Open reading frames(ORFs)
Sequence features.
Sequence conservation.
Evidence for transcription.
Gene inactivation.
三、论述题
1.Science、Nature杂志将“Small RNARNAi”评为2002年度重大科技成果之一,是RNA研究的突破性进展,是生物科学近20年来,可与HGP相提并论的最重大成果之一,你认为这种评价合适吗?为什么?
答:
1)small RNA RNAi可以调节和关闭基因的表达,能调控细胞的各种高级生命活动。
2)small RNA RNAi的发现大大地提升了人们对RNA分子的认识,开辟了RNA分子功能研究的新领域。
3)小RNA和RNA干扰研究具有广泛的应用前景,它有可能掀起一场生物革命,首先RNAi是一项快速、高效、便于操作的使靶基因失活的技术,因此它可以象基因敲除一样非常有效地鉴定特定基因的功能。随着各种模式生物的基因组计划的完成,生物学家们已经可以方便的从数据库中获得全基因组序列,从而找到研究者感兴趣的基因的序列,据此设计出dsRNA就可以使该基因沉默,这是研究疾病机理和鉴定候选药靶的关键步骤,也为将来可控地打开或者关闭某一特定基因这一目标奠定了基础。
4)small R
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