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基因组学与应用生物学,2011年,第30卷,第1261-1271页 Genomics and Applied Biology, 2011, Vol.30,1261-1271 数据分析 An Analysis 草莓 NAC 基因家族生物信息学分析 张春华 1 刘洪 2 俞明亮 1 葛安静 3 董清华 3 1 江苏省农业科学院园艺研究所, 南京, 210014; 2 南京农业大学园艺学院, 南京, 210095; 3 北京农学院植物科学技术学院, 北京, 102206 通讯作者: mly1008@; 作者 基因组学与应用生物学, 2011 年, 第 30 卷, 第 41 篇 DOI: 10.5376/.2011.30.0041 收稿日期：2011 年 7 月 4 日 接受日期：2011 年 7 月 22 日 发表日期：2011 年 7 月 25 日 这是一篇开放阅取的论文，其论文发布和传播接受《Creative Commons Attribution License》所有条款。只要对本原作有恰当的引用，版权所有人 允许和同意第三方无条件的使用、传播以及任何媒介的复制或再制作。 建议的引用格式如下： Zhang et al., 2011, Bioinformatics Analysis of the NAC Gene Family in Strawberry, Jiyinzuxue Yu Yingyong Shengwuxue (Genomics and Applied Biology), Vol.30 No.41 pp.1260-1270 (DOI: 10.5376/.2011.30.0041) (张春华等, 2011, 草莓 NAC 基因家族生物信息学分析, 基因组学与应用生物学, Vol.30 No.41 pp.1260-1270 (DOI: 10.5376/.2011.30.0041)) 摘 要 NAC 基因家族是植物特有的且具多种生物功能的转录因子，该家族基因广泛参与多个植物生长发育过程以及生物 与非生物逆境应答等。进行草莓 NAC 基因家族信息发掘对于草莓及其它蔷薇科植物的遗传改良方面具有深远前景。本文利 用生物信息学方法对 132 个 NAC 基因在连锁群上的分布、假定 NAC 蛋白质的分类、理化特性及结构进行了预测和分析。 结果显示具有 NAC 结构域的 132 条草莓氨基酸序列认为是假定 NAC 蛋白质，它们与拟南芥 94 个 NAC 氨基酸序列共分为 18 个亚族；连锁群定位结果发现其中 114 个草莓 NAC 基因分布在草莓 1-7 号连锁群上，其余 18 个基因未能搜索出其所属 连锁群。不同亚族间草莓假定 NAC 蛋白质理化特性存在一定的差异；其中 125 个草莓假定 NAC 蛋白质二级结构以无规则 卷曲为主要构成元件，其余 7 个以α-螺旋为主要构成元件。132 个假定 NAC 蛋白质中有 121 个具有三级结构，且它们的三 级结构大部分相似。 关键词 草莓; 拟南芥; NAC 基因家族; 生物信息学 Bioinformatics Analysis of the NAC Gene Family in Strawberry 1 2 1 3 3 Zhang Chunhua Liu Hong Yu Mingliang Ge Anjing Dong Qinghua 1 Institute of Horticulture, Jiangsu Academy of Agricultural Sciences, Nanjing, 210014; 2 College of Horticulture, Nanjing Agricultural Universi