耐高温酸性α2淀粉酶基因部分序列的克隆与分析.pdfVIP

耐高温酸性α淀粉酶基因部分序列的克隆与分析 1 ,3 2 2 2 1 王淑军 ,邓祥元 ,李富超 ,秦 　松 ,陆兆新 ( 1. 南京农业大学 食品科技学院 ,江苏 南京 2 10095 ;2 . 中国科学院 海洋研究所 , 山东 青岛 26607 1 ;3 . 淮海 工学院 ,江苏省海洋生物技术重点建设实验室 江苏 连云港 222005) α ( ) 摘要 :利用已报道的 淀粉酶基因序列的保守区域设计引物 ,通过聚合酶链式反应 PCR 获 得了高温球菌 The rm ococcus sp . HJ 2 1 的耐高温酸性 α淀粉酶基因的部分序列 。通过对该 序列的同源性比较分析发现 ,高温球菌 T he rm ococcus sp . HJ 2 1 与热水高温球菌 The rm ococ cus hy d rot herm al is 和 T he rm ococcus sp . O GL20 P 的亲缘关系最近 ,序列相似度达到 95 % (βα) 以上 ;利用 Swi ss Mo del 预测该基因产物的 3 级结构 ,显示其具有典型的 / 8 桶状结构 ;通 过分析密码子的使用情况得知 ,该α淀粉酶存在着密码子的兼并性和使用的偏向性问题 。 关键词 :高温球菌 ;α淀粉酶 ;基因克隆;序列分析 中图分类号 :Q785 　　文献标识码 :A 　　文章编号 (2007) α α 　　 淀粉酶 ,系统名称为 1 ,4葡聚糖4葡聚糖水 本研究利用分离 自深海热液喷口的高温球菌为 ( 解酶(α1 ,4glucan4glucanohydrolase EC. 3 . 2 . 1. 1) ,是 研究对象 ,通过 N CB I http :/ / www . ncbi . nlm . nih . [ 1] gov) 数据库中报道的已知序列 ,设计引物 ,扩增了α 重要的工业酶制剂之一 , 约 占整个酶制剂市场的 25 % , 已被广泛应用在食品、发酵 、纺织 、造纸和制药 淀粉酶基 因的部分序列 。该菌的最适生长温度为 等诸多行业[2 ] ;但现在应用的 α淀粉酶大部分都存 88 ℃,属典型的嗜热厌氧菌 ,而且在其培养液中检测 α α 到了 淀粉酶的活性 ,初步研究发现该 淀粉酶热 在着热稳定性较差和 p H 范围较窄等方面的缺陷 ,导 致工业生产成本的增加 。要使工业生产过程中α淀 稳定性好且具有较好的耐酸性 ,但由于其难于培养 ,