大型多元统计软件primer 的方法原理和其在底栖群落生态学中的应用.pdfVIP

维普资讯 第 33卷 第 1期 青 岛 海 洋 大 学 学 报 2003年 1月 JOURNALOFOCEAN UNIVERSITY OFQINGDAO 研究报告 大型多元统计软件 PRIMER的方法原理 及其在底栖群落生态学中的应用 周 红 张志南 (中国海洋大学海洋生命学院，青岛266003) 摘 要 本文阐述大型多元统计分析软件 PRIMER的原理及其在底栖生态学 中的应用 。PRIMER 是处理生态和环境多元数据的重要数值分析工具，本文从实用的角度对其中包括的技术方法和相应 的子程序如：等级聚类 (CLUSTER)、非度量多维标度 (MDS)、主分量分析 (PCA)、相似性分析检验 (ANOSIM)、相似性 百分 比分析 (SIMPER)、生物一环境连接的逐步分析和相关检验 (B10ENV／ BVSTEP)等作 了较为系统的介绍 。 关键词 多元统计分析 ；底栖生态学 ；PRIMER 中图法分类号 Q一332 文章编号 1001—1862(2003)01—058—07 20世纪 70年代 ，随着计算机技术的发展，多元统计分析技术被广泛应用于群落生态学的 研究，由此产生了统计学派的连续统群落概念与传统的优势种学派的刚性群落之间的分水岭。 底栖群落生态学的研究在经历了近一个世纪的发展过程后，逐步 由单纯的野外观测和描述转 入实验生态，对系统演化的考虑及污染和扰动对群落结构的影响评价。对假设的检验 ，无论在 实验室或野外 ，都变得极为重要 。多元统计分析方法在底栖生态学领域的应用也随之得以不断 发展和完善 。 我国底栖生态学研究虽起步较晚，但伴随着实验生物海洋学及小型底栖生物研究的 日趋 活跃和对生物扰动、水层一底栖耦合研究的深入 ，底栖生态学更注重在生态系统水平上对过程 和机制的研究。改进传统的丰度一生物量描述方法，在研究和调查中纳入实验 ／取样设计的理 念 ，在数据处理中采用国际通用的统计方法和软件，已势在必行。这就要求我们对在群落生态 研究中应用广泛的多元统计技术有较为全面的了解。本文从底栖群落生态研究的角度 ，重点介 绍大型多元统计软件 PRIMER (PlymouthRoutinesInMultivariateEcologicalResearch)的 方法原理及应用 。 1 方法原理 多元统计分析即多变量分析，是 1套能对多元(多种)丰度 ／生物量数据矩阵做出图形表达 ·国家 自然科学基金项 目、国家重点基础研究专项经费(G1999043709)资助 收稿 日期：2002—10-21；修订 日期：2002—11—16 周 红，女，1966年出生，博士，讲师。E—mail：hzhou@graduate．hku．hku．hk 维普资讯 1期 周 红，等：大型多元统计软件PRIMER的方法原理及其在底栖群落生态学中的应用 59 和统计检验的技术方法，可分为参数(parametric)和非参数(non—parametric)2大范畴，最常用 的有分类 (classification)和标序 (ordination)。多元统计分析在群落生态研究中的应用基本遵 循参数和非参数 2条发展路线 。前者 比较经典，主要应用于陆地植物生态；后者始于上世纪 80 年代初n3，首先在海洋软底群落的研究中得到广泛应用r2]。非参数技术的基础是对 2个样品相 似性的定义口]。这个定义有着生物学相关性，所采用的简单等级形式，如：样品A与B比样品 c更相似 ，降低了对数据必须满足某些统计学假设的要求 ，应用上更简单和灵活，适用范 围更 广 。 PRIMER正是基于以等级相似性为基础 的非参数多元统计技术而开发的大型多元统计 软件 ，已被广泛应用于海洋群落的结构、功能和生物多样性 的研究，并逐渐向生态监测和环境 评价的方 向发展 。早期版本 由英国普利茅斯海洋研究所推出，最新版本 PRIMERv5(网址 ： http；／／www．pm1．ac．uk／primer／index．htm)所包括