启发式方法研究5甲硫腺苷核苷酶抑制剂定量构效关系.pdfVIP

第32堂第劣 成都大学学报(自然科学版) Vbl．32No．2 Science 20l of Edition) Jun．2013 3年6月 JournalChengduUniversity(Natural 文章编号：1004—5422(2013)02—0109—04 启发式方法研究5’．甲硫腺苷核苷酶 抑制剂定量构效关系 刘坤平1，李惠茗1，赵琦1，颜军1，郭晓强1，甘亚1，张晓昀2，苟小军1 730000) (1．成都大学生物产业学院，四川成都610106；2．兰州大学化学化工学院，甘肃兰州 摘要：定量构效关系的研究已成为化学和环境科学研究中的一个前沿领域．对29个甲硫腺苷核苷酶抑制剂 的结构进行优化得到描述其分子结构的5类描述符，并选择6个描述符运用启发式方法和III婀州方法分剐建 立了描述29个5’．甲硫腺苷核苷酶的结构与其对5’．甲硫腺苷核苷酶的抑制活性之间的线性和非线性QSha模 HM模型，具有较好地预测和反映真实情况的能力，这为预测其他类似物的活性和设计新的抑制剂提供了理论 依据． 关键词：定量构效关系；甲硫腺苷核苷醇抑制剂；启发式；径向基人工神经网络 中图分类号：0625．9 文献标志码：A 类似物，并通过实验测定了它们与MTAN的平衡解 0引 言 作为5’一甲硫腺苷核苷酶(删)的专一催化底 离常数K的生物活性数据．然而，这种费时、昂贵的 生物实验无法大规模用于大量药物的筛选．因此，建 物，5’一甲硫腺苷(MTA)是生命有机体中重要的代谢立数学模型以预测MTAN抑制剂生物活性的定量构 产物【1】，在细菌甲硫氨酸循环、嘌呤合成补救、生物 效关系(QSAR)方法引起了研究人员的关注． 甲基化与多胺合成4个基本代谢途径中起关键作 QSha方法是以描述化合物的结构信息的描述 用．它可被催化生成生成5’．甲硫核糖(MIR)和腺嘌 符为参数，通过多元线性回归、支持向量机和人工神 呤，而MTR经过一系列酶作用最终生成甲硫氨酸， 经网络等线性或非线性等方法建立化合物结构和生 从而实现生物体内甲硫氨酸的循环补救[2J．研究表 物活性之间的数学模型，从而实现快速药物筛选． 明，MTAN广泛地存在于病原体微生物内，如金黄色Q刚咀方法主要包括数据的收集、分子结构描述符 葡萄球菌、肺炎链球菌、霍乱弧菌和炭疽芽孢杆菌 的产生和选取、模型的建立和评价．目前，用于分子 等，可直接参与对群体感应途径自诱导物质AI．1及 结构描述符主要有拓扑、组成、几何、静电、量子化学 趾．2的合成，并在细菌新陈代谢通路中起重要作用， 等【6J．本研究中，我们运用启发式(蹦)方法和径向 与细菌代谢、毒力和生物膜的形成等密切相关．然 而，哺乳动物体内体内缺乏此酶，其MTA的分解是 软件计算选择出来的描述符，建立了预测能力较强 通过MTA磷酸化酶(MTAP)实现的[3]，这导致了病 的Q沁模型，并利用该模型预测了29种删抑 原微生物与其宿主生物间对相同底物采取不同代谢 制剂的生物活性，拟为预测其他类似物的活性和设 方式的差异，进而引起了科研人员对抑制MTAN活计新的抑制剂提供一定的理论依据． 性的关注，使得MTAN成为新的药物研究靶标[4】．此 1数据和方法 外，国内外的相关研究已证明，MTA底物的积累可 以抑制MTAN的活性，而寻找新的MTA类似物研究