葡萄孤儿基因的表达分析和功能推测.pdfVIP

基因组学与应用生物学，2013 年，第32卷，第2期，第240-245 页 GenomicsandAppliedBiology,2013,Vol.32,No.2,240-245 数据分析 DataAnalysis 葡萄孤儿基因的表达分析和功能推测 1 2* 2 1 李成慧 蔡斌 梁英海 贾士禄 1苏州农业职业技术学院, 苏州,215008;2南京农业大学园艺学院,南京,210095 *通讯作者,caibinperl@163.com 摘 要 孤儿基因为某物种基因组内特有的，在其它物种内没有同源基因存在的特殊基因。对物种孤儿基因 的鉴定和分析已成为比较基因组学研究的一个新兴领域。本研究通过生物信息学的分析，着重研究了49 个 葡萄孤儿基因在各发育阶段和各器官中的特异表达特性、亚细胞定位预测和共表达基因群的生物学过程基 因本体论(GO)分析。结果显示，35 个基因在NCBI 的EST 数据库中存在EST表达证据，其中有7个基因具 有器官表达特异性，且大部分在生殖器官中特异表达。通过亚细胞定位预测到大部分葡萄孤儿基因为分泌蛋 白。GO分析表明葡萄孤儿基因的共表达基因群主要参与寡肽转运和跨膜运输等生物学过程，这与葡萄孤儿基 因的亚细胞定位预测结果相一致。本文研究结果将为葡萄孤儿基因的进一步功能分析提供