基因芯片技术在甘蔗研究中的应用进展.pdfVIP

基因组学与应用生物学，2013 年，第32卷，第2 期，第267-271 页 GenomicsandAppliedBiology,2013,Vol.32,No.2,267-271 评述与展望 ReviewandProgress 基因芯片技术在甘蔗研究中的应用进展 侯平 王英 高和琼 庄南生* 海南大学热带作物种质资源保护与开发利用教育部重点实验室,海口,570228 *通讯作者,zhuangns@163.com 摘 要 基因芯片技术是新生代的生物技术，具有大规模平行处理生命信息的能力。基因芯片具有高通量、 并行性、微型化与自动化的特点，因此成为探究功能基因组学最有效的方法之一，已引起全世界广泛的关注 和重视，在许多领域得到了广泛的应用。甘蔗是世界上急需研发的重要能源作物，基因芯片对甘蔗研究有重 要的意义。本文简介了基因芯片技术的原理和制备过程，并着重阐述了在甘蔗抗旱、抗病、基因表达和miR- NA 鉴定方面的应用进展。 关键词 甘蔗,基因芯片技术,基因表达 ApplicationofGeneChipTechnologyinStudyofSugarcane HouPing WangYing GaoHeqiong ZhuangNansheng* KeyLaboratoryofProtectionandDevelopmentUtilizationofTropicalCropGermplasmResources,MinistryofEducation,Haikou,570228 *Correspondingauthor,zhuangns@163.com DOI:10.3969/gab.032.000267 Abstract Genechipisnewgenerationbio-techniquehaving anabilitytodealwithmassivelife-informationsi- multaneously.Foritpossessesthefeaturesofhigh-throughout,parallel,minimizationandautomation,genechipis tobeoneofthemosteffectivetechnologiesofstudying thefunctionalgenomics,whichhascausedtheextensive concernintheworldduetoitsvalueandachieved themoreandmoreextensiveapplicationinmanyfields.Sugar- caneisemergenttobedevelopedasimportantenergysourcesintheworld.Itisimportanttocarryoutstudyingon sugarcanebyusinggenechip.Inthisreview,weherehadasimplesummaryofgenechipregardingitstheoryand manufactureresearch,andespeciallydescribetheprogressinsugarcaneresearchfromfourpointsmainly,including droughtresistance,diseaseresistance,geneexpressionandmiRNAappraisal. Keywords Sugarcane,Genechip,Geneexpression 基因芯片(genechip)，就是将大量已知的核酸探 Schenaetal.,1995)，随着科技的不断发展，芯片的研 针按照一定的顺序密集地固定在特定的固体载体(玻 究一步步完善，不断推动生命科学的全面发展。 璃片和硅片等)上，形成核酸点阵。基因芯片的设计理 甘蔗是重要的能源植物，在能源日益紧张的今 念源自计算机芯片，充分融合了生物信息学、物理、 天，加快甘蔗等能源植物的研究有着重要的战略意 计算机、微电子等学科的研究成果，具有集成化、高 义。基因芯片在甘蔗方面的研究主要是对处于逆境 通量和平行性强等优点，可以对核酸分子进行快速 或者病害胁迫下的甘蔗进行基因表达水平的检测， 高效的检测(Gershon,2002)和分析，因此得到了快速 再通过分析实验数据寻找差异表达基因，进行功能 的发展(Case-Greenetal.,1998)。 分类和注释。 1991年，Fodor 等(1991)第一次提出DNA 芯