代谢组学及其在中医药现代化研究中的应用进展.pdfVIP

· 698· !生 旦筮 鲞笠 塑 ChinJDifficandComplCasN0vember2009．Vo1．8N0．11 ， 代谢组学及其在中医药现代化研究 中的应用进展 魏聪综述 吴以岭审校 基金项 目：国家重点基础研究发展汁划 (973计划)项 目(No．2005CB523301)，科技部国际科技合作项 目(No．2006DFB32460) 作者单位：050035 石家庄，河北以岭医药研究院 【关键词】 代谢组学；中医药；现代化；进展 【DOI】 10．3969／j．issn．1671—6450．2009．11．033 基于基因功能的复杂性和生物系统的完整性，以整体性研 分析 、标志物识别和途径分析等。 究为特征的系统生物学 (systemsbiology)成为 “21世纪医学和 生物样品可以是尿液、血液、组织 、细胞和培养液等，采集 生物学的核心驱动力”，“组学”研究逐渐引入医学科学研究中， 后首先进行灭活、预处理，然后运用核磁共振技术 (MR)、液相 对机体各层次生理 、病理、治疗、转归的功能实现 、涌现行为、整 色谱质谱联用技术 (LC—MS)、毛细管电泳质谱联用技术 (cE— 合机制 日益受到关注。基 因组学 (genomics)、转录组学 (tran— MS)以及气相色谱质谱联用技术 (GC—MS)等分析手段，检测其 seriptomics)、蛋白质组学 (proteomics)、代谢组学 (metabolomics／ 中代谢物的种类、含量、状态及其变化，其中NMR特别是氢谱 metabonomics)构成四大基本组学层次，其中参与新陈代谢、维 以其对含氢代谢产物的普适性，色谱以其高分离度、高通量，质 持其正常功能和生长发育的小分子物质，在体内或拮抗、或协 谱 以其普适性、高灵敏性和特异性成为最主要的分析工具。 同、或修饰而相互影响，成为机体神经内分泌及免疫网络调节 代谢组学分析产生的多维数据，需充分运用化学计量学理 的物质基础和 自稳态调控的重要成分 。，这些仅微量存在即可 论和多元统计分析方法进行压缩降维和归类，通常采用模式识 发挥较强生物学效应的小分子物质形成 的代谢网络 由于处于 别，其中包括无监督模式识别和监督模式识别，目前常用的有 基因调控、信号转导和蛋白质交互作用网络的下游，更能反映 主成分分析 (PCA)、层次聚类分析 (HCA)、非线性映射 (NLM) 上述组学受内外环境影响后相互协调作用的最终结果，因此更 等非监督分类方法，以及偏最小二乘法一判别分析 (PLS—DA)、 接近细胞或生物的表型。中医药作为朴素唯物主义哲学观升 一 最临近法 (—NN)和神经网络 (NN)等监督分类方法 ，其中以 华的结晶与2000余年临床经验的积淀，在其现代化研究进程中 PCA方法最为常用 J。 缺乏适合的科学表达体系，成为阻碍中医药发展的 “天堑”，系 1．3 代谢组学优势分析及应用现状 代谢组学分析具有一系 统生物学尤其是代谢组学的迅速崛起及发展为中医药现代化 列优势：(1)由于代谢组处于组学功能活动的终点，对基因和蛋 研究提供了契机，成为沟通中医药与现代医药研究的桥梁。 白质表达的微小变化具有放大作用因而更易检出。(2)无需建 1 代谢组学研究概况 立全基因测序及大量表达序列标签数据库 ，且代 十物的种类要 1．1 代谢组学含义及研究层次 机体作为动态的、多因素综 远小于基因和蛋白的数 目，减少样本的复杂性。(3)代谢物谱 合调控的复杂体系，需通过不断调节 自身复杂的代谢网络来维 在不同生物样本中基本一致 ，再加上其检测技术的多样性，代 持系统内部以及与外界环境的正常动态平衡 。。代谢组学即 组学的研究具有较好的便利性。(4)实现无损伤性、接近生 是通过考察生