大黄鱼野生群体与养殖群体遗传多样性研究.pdfVIP

研究报告只 大黄鱼野生群体与养殖群体遗传多样性研究 陈淑吟 ,徐士霞,张志勇 ,郭忠仁 ,孙中响 ,朱立静 ,。 .江苏省海洋水产研究所,江苏 南通; .南京师范大学 生命科学院 动物遗传资源研究所,江苏 南 京, ; .苏州大学 医学部基础医学与生物科学学院,江苏 苏州 摘要:利用线粒体基因序列片段与标记方法,研究江苏海域大黄鱼 野 生群体 的遗传多样性水平,并比较其与浙江 、福建 养殖群体的遗传差异 结果表明: 扩增 基因序列片段, 个群体 个序列中有 个单倍型,群体间有 个共享单倍型; 野生群体 有 个独享单倍型,另有 个单倍型与 群体共享;群体间的遗传分化水平很低,其中: 与 、 的遗传分化系数 ,分别为一 .和 . , 与 的 为一 .; 筛选出 个标记多态 引物,分析得出 、 及 的多态位点百分率分别为 . %、 . %. . %;群体间的 ’ 遗 传一致度 为 .~ . 。其中 与 、 的 分别为 .和 . , 与 的 为 .。 关键词:大黄鱼 ; ;;遗传多样性;群体遗传差异 中图分类号:文献标识码: 文章编号: .. 大黄鱼 被应用于许多水生生物种群遗传学研究中,但目前 尚未见用于大黄鱼的群体遗传学研究。作者利用线 隶属鲈形目、石首鱼科 、黄 粒体基因序列片段与标记方法研究大黄鱼 鱼属 ,主要分布于中国黄海南部、东 江苏吕泗渔场自然群体的遗传多样性,并比较其与 海和南海,为暖温性近海集群洄游鱼类,一般体长 浙江、福建主产区两个养殖群体间遗传差异,为大黄~,最大可达,曾是中国传统的“四大 鱼资源保护与利用提供更多依据。 海鱼”之一。 世纪年代以前,大黄鱼具有明显 的渔场和渔汛期。由于酷渔滥捕和环境污染,大黄 材料与方法 鱼自然资源几近枯竭,到 年代以后形不成渔汛。 . 样本来源与总基因组提取 渔业部门虽然制订了许多资源保护措施,但至今大 黄鱼仍属东海区资源严重衰退的种类【。 世纪大黄鱼 个群体样本取样时问在 年 月。江苏野生群体样本 , 个于吕泗渔场海区为 年代末刘家富等】研究成功人工繁育大黄鱼,现在 次捕捞得到,体长 . ~ .;两个养殖群体样 大黄鱼人工养殖产业化规模在福建、浙江等地不断 本分别来自浙江象山港 , 个和福建宁德 , 壮大,但伴随着产业发展又面临着大黄鱼品质下降、 个养殖海区,体长分别为 .. 、 . . 。 病害频发的局面,进行科学管理对保护和恢复大黄 基因组总 提取采用 提取试剂盒 鱼资源相当必要 。近几年来,开展的人工放流大黄 , ,按试剂盒说明书要求操作,最后 鱼对恢复几近枯竭的自然资源具有积极意义,而对 洗脱定溶于/ 溶液中, ℃保存备用。 现有遗传资源的了解有助于进一步保护该资源的遗 传多样性。 . 引物设计与扩增 中国黄海南部的吕泗渔场为大黄鱼主要自然分 根据鱼类通用引物【以及从 数据库下 布区之一,目前大黄鱼自然资源也十分稀少,有关 该海区大黄鱼的种质状况及其与其他群体的遗传差 收稿日期:? ? ;修回日期: ? 异未有报道;而且,该海区是目前尚未开发人工养 基金项目:“十一五”国家科技支撑计划重大项目 作者简介:陈淑吟.,女,广东汕尾人,研究员,博士,主要从事 殖的大黄鱼主要分布海域。线粒体基因序列作 海洋水产种苗繁育与遗传资源研究,电话:, ? :? 为功能稳定又具较多变异的序列,作为分子标记已’. 海洋科学/年/第 卷/第 期研究报告只 载大黄鱼的序列,设计扩增基因序列引物, . 扩增的电泳检测及数据分析 序歹 为: . : ’一 扩增产物在 电泳仪上进 一 ’/. : ’. 行检测,电泳缓冲液为 . ,琼脂糖凝胶浓度 一 ’。引物由上海生工生物工程 为 .%含 . / ,电压不超过 / ,电泳 技术服务有限公司合成。 ~ 后取出,于.紫外成像仪下拍照记 反应总体积为,含有:模板约录。,浓度为 引物各 , 按照电泳图谱中同一位置上带的有无进行 聚合酶混合液 , : 。扩增参数 统计,有带记为? ’,无带记为“ ”,记录清晰、稳定 为: ℃预处理 ;进行 循环: ,且长度在~范围内的扩增带,将图谱转化 ;最后延伸。 为 / 矩阵。应用 . 软件在假定种群处 产物在 . %琼脂糖凝胶中电泳,溴化乙锭 于?平衡状态下,应用 分 , 染色,凝胶成像系统检测。产 析群体遗传参数方法,分别计算多态位点百分率 物经试剂盒 , :切胶纯化后送上海 尸、群体总基因多样性 、群体内基因多样性 用反应引物双向测序。测序仪器为 、群体间的遗传分化系数 ,并根据 ’ 遗传,测序试剂为 . 。 距离,对群体进行 树聚类分析。 群体多态性位点百分率 该群的多态性位 . 序