4株H3N2亚型猪源流感病毒HA基因的序列测定与特性分析.pdfVIP

1424 中国兽 医学报 2009年11月 第29卷 第 l1期 ChinJVetSciNov．2009 Vo1．29 No．11 4株 H3N2亚型猪源流感病毒 HA基因的序列测定与特性分析 李 敏 ，向 华。，宣 华 。 (1．吉林大学 畜牧兽医学院，吉林 长春 130062；2．广东省农业科学院广州兽医研究 所，广东 广州 510640) 摘要 ：从广东省不 同猪场分离到 4株 H3N2亚型猪源流感病毒 A／swine／Guan ong／o1／2O。4、A／swine／Guang— dong／02／2004、A／Swine／Guangdong／O3／2()04、A／Swine／Guangdong／O4／2。04。根 据 GenBank公布 的 H3N2亚型 猪源流感病毒 的HA基 因序列，设计 1对 引物 ，运用RT—PCR方法扩增 四株病毒 的HA基 因，并进行测序和分析。 同源性分析和遗传进化分析表 明本实验的4株 H3N2亚型SIVHA基 因核苷酸序列同源性为99．8 ～99．9 ，在 遗传进化树q-均位于同一分支上。与参考毒株的比较分析表明，4个毒株与WHO推荐的 2001--2004年北半球 H3N2亚型流感疫苗株 A／Moscow／10／99HA基 因的核苷酸序列 同源性最高为 99．4 ～99．5 ，4个毒株与 A／ Moscow／10／99HA基 因在遗传进化树 中位于同一个小分支上。氨基酸序列比较发现 ，4个毒株 HA基 因裂解位 点处的氨基酸序列均为PEKQTR+G，4个毒株推导的氨基酸序列 中均有 11个糖基化位点，4个毒株 HA蛋 白226 位受体结合位点(RBS)处氨基酸均为异亮氨酸 (I)。4个毒株 HA基 因的氨基酸序列、受体结合位点以及糖基化 位点均与 A／Moscow／10／99相应的氨基酸序列一致。本试验的4株 H3N2亚型猪源流感病毒 的HA基 因属于以 A／Moscow／10／99为代表的近代类人 H3N2亚型流感病毒 ，在一定程度上揭示 了广东省 H3N2亚型猪流感病毒 HA基 因进化与流行情况。 关键词 ：猪流感 ；H3N2亚型；HA基 因；序列测定与分析 中图分类号：$852．65 文献标识码 ：A 文章编号 ：1005—4545(2009)11—1424—05 HA genesequencingandanalysisoffourstrainsH3N2Subtypeswineinfluenza virus LIMin～，XIANG Hua。，XUAN Hua’ (1．CollegeofAnimalandVeterinaryMedicine，JilinU- niversity，Changchun130062，China；2．InstituteofVeterinaryMedicine，GuangdongAcademy ofAgriculturalScience，Guangzhou510640，China) Abstract：FourstrainsofH3N2subtypeswineinfluenzaviruses，namedasA／Swine／Guangdong／01／2004，A／ Swine／Guangdong／02／2004，A／Swine／Guangdong／03／2004，A／Swine／Guangdong／04／2004，wereisolatedfrom pigs with influenza—likesignsinGuangdongprovincein2004．Reversetranscription—polymerasechainreaction (RT—PCR) wasusedtoamplifytheHA genesegmentsforsequencinganalysis．Asdemonstratedbyhomologyandphylogenica— nalysis，itwasfoundthathigherhomologuesinthecorrespondingnucleotidesequenceandclosedrelationshipexisted inthesestrainsofSIVandalsowiththerecommentedvirusA／Moscow／10／99．Asdemonstrate