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第51 卷 第 14 期 2006 年7 月 论 文
哺乳动物驱动蛋白的计算基因组学分析与鉴定
薛 宇 * 刘 丹 * 符传孩 窦 震 周 庆 姚雪彪 †
( , 230027; , 310003.
中国科学技术大学细胞动力学实验室及合肥微尺度物质科学国家实验室 合肥 浙江大学农学院 杭州
* . † , E-mail: yaoxb@)
同等贡献 联系人
摘要 提供了一种新颖的 基于比较基因组学方法的全长驱动蛋白预测方法(full-length kinesin
prediction program, FKPP), . ,
用于哺乳动物中驱动蛋白质组的鉴定与研究 之前的预测认为 哺乳动物共
94 , FKPP 134 .
含 个驱动蛋白 而用 从哺乳动物的基因组中总共鉴定出 个可能的驱动蛋白基因 基于数
, FKPP 25 . , FKPP
据库中存在的片段序列 用 鉴定出 个可能的全长驱动蛋白 此外 用 方法发现人的动点
CENP-E 2701 , 2663 . CENP-E
马达蛋白 应包含 个氨基酸 而不是当初根据克隆预测的 个氨基酸 通过对
cDNA , FKPP CENP-E , ,
的 进行重测序 并同时采用特异性识别 预测的 多肽抗体予以实验评估 结果表明
FKPP CENP-E . , FKPP
预测的 氨基酸序列是正确的 为此 本研究利用 对哺乳动物的驱动蛋白进行了重
. , FKPP
新分类 鉴于目前公共数据库含有较多非全长序列的蛋白片段 可提供一个具有显著效率且准确
, .
新颖的全长序列预测手段 用
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