绰墩山遗址古水稻土细菌与古菌群落的PCR-DGGE分析.pdfVIP

维普资讯 第 28卷第6期 生 态 学 报 V01．28．No．6 2008年 6月 ACTA ECOLOGICA SINICA Jun．，2008 绰墩 山遗址古水稻土细菌与古茵群落的 PCR-DGGE分析 申卫收 ，尹 睿 ，林先贵 一，褚海燕 ，胡正义 ，曹志洪 ’ (1．中国科学院南京土壤研究所土壤与农业可持续发展 国家重点实验室，南京 210008； 2．中国科学院南京土壤研究所一香港浸会大学土壤与环境联合开放实验室。南京 210008；3．中国科学院研究生院，北京 100049) 摘要：在江苏苏州绰墩山遗址考古发掘中，发现了在剖面不同深度埋藏的距今约6280a的新石器时期灌溉古水稻 田土层和距 今约3320a的商周时期的古水稻田土层。为了解古代水稻种植活动对土壤中细菌、古菌及产甲烷古菌群落多样性的影响，以 土壤剖面P一0l(包含 100～116cm新石器时期水稻土，42～57cm商周时期水稻土，0—15cm现代水稻土和 174—200cm土壤母 质)为对象，利用细菌、古菌及产甲烷古菌群落 16SrDNA的高可变区V3区的PCR—DGGE分析技术 ，研究了不同土层细菌、古 菌及产甲烷古菌群落多样性。结果表明：利用PCR—DGGE技术成功获得了古水稻土细菌 、古菌及产甲烷古菌群落的分子指纹 图谱。现代水稻土、商周时期古水稻土和新石器时期古水稻土中细菌、古菌及产甲烷古菌群落的DGGE条带类型各不相同，并 且DGGE条带类型都较母质层丰富多样。UPGAMA聚类分析可以将不同时期水稻土及母质层的细菌、古菌及产甲烷古菌群落 区分开来。埋藏古水稻土中仍有较多的细菌、古菌与产甲烷古菌存活。与母质层相比，不同时期水稻种植活动均增加了细菌、 古菌与产甲烷古菌群落多样性。不同时期水稻种植活动可以引起特异性的细菌、古菌与产甲烷古菌群落发育，而且不同的栽培 措施可能导致不同的优势种群。 关键词：古水稻土；新石器时代；DGGE；古菌；产甲烷古菌 文章编号：1000—0933(2008)06—2916—09 中图分类号 ：Q3496，Q938，S154．36 文献标识码 ：A PCR．DGGE analysesofbacterialandarchaeal communitydiversitiesinancient paddysoilsdiscoveredinChuodunshanSite，Suzhou，China SHEN Wei—Shou，，YIN Rui，，LIN Xian—Gui’， ，CHU Hai—Yan，，HU Zheng—Yi，CAO Zhi—Hong 1StateKeyLaboratoryofSoilandSustainableAgriculture，lnstit~eofSoilScience，ChineseAcademyofSceinces，Nanjing210008，China 2JointomnLaboratoryofSoiland theEnvironment，InstituteofSoilSceinceand HongKongBaptistUniversity，Nanfing210008，China 3GraduateUniversityofChineseAcademyofSceinces，Bejiing100049，China ActaEcologicaSinica。2008。28(6)：2916～2924． Abstract：Ancientirrigated paddy soilsfrom the Neolithicageof6280 aBP and Shang—Zhou Period of3320 awere excavatedatChuo—dun—shanintheYangtzeRiverDelta，closetoSuzhou，JiangsuProvinceofChina．Theobjectiveofthis studywastocarryo