p53振子的形成机制及microRNA对p53目标基因表达的精细调控.pdfVIP

第 l7卷 第5期 上 戈 振 (自然科学版) V01．17NO．5 2011年 lO月 JOURNALOFSHANGHAIUNIVERSITY(NATURALSCIENCE Oct．2Oi1 doi：10．3969／j。issn．1007-2861．2011．05。011 p53振子的形成机制及 microRNA对 p53目标基因表达的精细调控 张志勇， 徐凤丹 (上海大学 理学院，上海 200444) 摘要：肿瘤抑制因子 p53调控着大量的基因，在肿瘤抑制中起着关键作用 实验结果表明，当DNA受损后，053的表 达呈现周期性振荡，已有的一些053振子的理论模型，其振子产生机制通常依赖于p53和Mdm2之间相互作用的时 滞因素．考虑基因表达的转录和翻译过程，运用动力学方程建模的方法，给出一种新模型，并利用 Hoof分叉理论，给 出p53振子产生的条件．数值模拟结果表明，与已有的时滞模型相比，该模型对参数具有更好的鲁捧性，较好地解释 了053振子的产生机制．最近的许多实验表明，053调控着miR-34家族中大量microRNA的表达，这些microRNA又 在后转录水平上对053的下游 目标基因起着调控作用．在这一模型基础上，研究microRNA加入 p53调控网络后所 起的调控作用，数值模拟结果初步表明，microRNA对053下游 目标基因表达起到了精细调控作用． 关键词：p53基因；microRNA；基因调控 中国分类号：029 文献标志码：A 文章编号：1007-2861(2011)05-0631-05 M echanism ofpS3OscillationsandM icroRNA Regulation of pS3TargetGenes ZHANG Zhi—yong， XU Feng—dan (CollegeofSciences，ShanghaiUniversity，Shanghai200444，China) Abstract：Asakeytumorsuppressor，p53playsan importantroleinthesuppressionoftumorgenesis， which functions as a transcription factor，controlling the expression ofa number of targetgenes． Oscillationsofp53expressionwereobservedafterDNA damage．Somemodelswereproposedtoexplain themechanism forp53oscillations．However，manyofthesemodelssuggestthatthetimedelaybetween p53andMdin2isthekeyfactortriggeringtheoscillations．Thispaperproposesanewmodelbasedon chemicalkineticsinwhich the transcriptional na d translational processare considered separately and sufficientconditionsforp53oscillationsaregivenby印plieationoftheHopfbifurcationtheory．Numerical simulationsindicatethatourmodelismore robusttoparametervariationscomparedwithh