蛋白水解酶催化机制研究.pdfVIP

第 32 卷 第 4 期 昆 明 理 工 大 学 学 报 ( 理 工 版 ) Vol. 32　No4 2007年 8月 　 　Journal of Kunm ing U n iversity of Science and Techno logy ( Science and Techno logy) 　Aug. 2007 蛋白水解酶催化机制的研究 邱开雄 ,简 虹 ,付继军 ,李映苓 ,黄大荣 (昆明医学院 基础医学部 ,云南 昆明 650031) 摘要 : 用 CNDO /2计算了模拟蛋白水解酶的不同底物中 ,酰胺键和酯键的电子参数及水解反应 的中间四面体产物的电子特性 ,表明取代基的特性和羰基形成的氢键不影响酰胺基的电荷和键 序. 讨论了酰胺的电子状态与它的平面结构的曲变程度密切相关. 指出在双环 β- 内酰胺中缺乏 共振稳定性. 在酰胺中 ,计算了不同杂化状态时 ,酰胺氮原子的不同 p Ka值. 关键词 : 蛋白水解酶 ;催化机理 ; 酰胺 中图分类号 : Q 814 文献标识码 : A 文章编号 : 1007 - 855X (2007) 04 - 0069 - 04 Study on Ca ta ly tic M echan ism of Proteoly tic Enzym es Q UI Ka ix io n g , J IAN Ho n g , FU J ijun , L i Yin g lin g , HUAN G D a ro n g ( Facu lty of B a sic M edical Science s, Kunm ing M edical Co llege, Kunm ing 650031, Ch ina) A b stract: E lectron ic p aram eters of am id and e ster in som e compound s modelling sub strate s of p roteo lytic en zym e s, and electron ic p rop ertie s of corre sponding tetrahedral compound s, wh ich are in term ed iate s of the hydro lytic reaction , are calcu lated by the CNDO /2 m ethod. The natu re of sub stituen ts and the form ation of the hydro gen bond by the carbonyl oxygen atom are shown to have no sufficien t influence on the charge and bond orders of the am ide group. The dram atic dep endence of the am ide electron ic state from the distort degree of its p lanar structu re is found. The re sonance stab ilization is shown to be ab sen t in the b icyclic β- lactam s. The p Ka value s of the am ide n itrogen atom are calcu lated at variou s hyb ridization state s in am ide s. Key words: p roteo lytic enzym e s; catalytic m echan ism ; acidam ide 0 引 言 蛋白水解酶是加速以下反应的重要生物催化剂 :