基于人类线粒体基因功能网络的线粒体蛋白功能预测.pdfVIP

基于人类线粒体基因功能网络的线粒体蛋白功能预测.pdf

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2013年3月 四川大学学报(自然科学版) Mar.2013 Science V01.50No.2 ofSichuan Edition) 第50卷第2期 Journal University(Natural doi:103969/j.issn.0490—6756.2013.02.032 基于人类线粒体基因功能网络的 线粒体蛋白功能预测 赵培虎,李 校,桂俊鸿,刘 震,张义正 (四川大学生命科学学院四川省分子生物学和生物技术重点实验室,成都610064) 摘 要:本研究旨在利用生物信息学的方法建立高可信度线粒体基因清单,通过整合14个全 基因组和线粒体水平的异质组学证据,利用朴素贝叶斯模型建立了线粒体基因功能网络,然后 基于此网络预测线粒体相关KEGG pathway新的组件,确定部分线粒体基因功能.本研究预 测得到78个线粒体相关KEGG pathway新的组件. 关键词:线粒体;基因功能网络;朴素贝叶斯模型;蛋白质功能预测 中图分类号:Q7s6 文献标识码:A 文章编号:0490—6756(2013)02.0391—08 Predictionofmitochondrialfunctionbasedonhuman protein mitochondrialfunctionnetwork gene ZHAO Pei—Hu,LIXiao,GUI Zhen,ZHANG Jun—Hong,LjU Yi—Zheng (Sichuan ofMolecularand KeyLaboratory BiologyBiotechnology, ofLifeSciences,Sichuan 6 College 10064,China) University,Chengdu Abstract:Thisresearchaimedtoestablisha confidentlistofmitochondrialwith high genes bioinformat- ics modelofMitochondrialfunctionnetworkareestablished of14 methods.Bayesian evidences gene by andmitochondrial1evel of integratedgenome omics.ThefunctionsSeveralmitochondrial heterogeneous are determinednewmitochondria—relatedKEGG whichare

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