宏基因组的构建及应用.pptVIP

快速有效筛选目标微生物的新方法 —宏基因组的构建及应用 专业： 微生物学 学号： 姓名： 张爱平 宏基因组学 第一节 什么是宏基因组学 第二节 宏基因组学技术流程 第三节 宏基因组学的应用 第一节 什么是宏基因组学 宏基因组(the genomes of the total micro biota found in nature)是指生境中全部微生物基因的总和。它包含了可培养的和未培养的微生物的基因总和，微生物主要包括环境样品中的细菌和真菌。 第二节 宏基因组学技术流程 从环境中提取宏基因组DNA； 用核酸内切酶切割成一定长度的DNA片段并连接到合适的载体上； 转化宿主菌，形成一个重组的DNA文库即宏基因组文库； 宏基因组文库筛选。 一、环境样品DNA提取 提取步骤通常需要满足两个条件： ①尽可能提取样品所有微生物的基因， ②保持片段的完整和纯度。 目前所开发的DNA提取方法有两种： 细胞提取法和直接裂解法 直接裂解法：物理法：冻融法、超声法、玻璃球珠击打法、液氮碾磨法 化学法：常用化学试剂有表面活性剂、盐类、有机溶剂等 酶裂解法 依据提取样品总DNA前是否分离细胞，可以分为原位裂解法和异位裂解法。 1、原位裂解法（直接提取法）