贵州省新城疫分子流行病学研究.pdfVIP

贵州农业科学 2010，38(2)：145～147 GuizhouAgriculturalSciences [文章编号]1OOl一3601(2010)02—0109—0145—03 贵州省新城疫分子流行病学研究 高 颖，殷俊磊，伍祥龙，周碧君 ，文 明 ，温贵兰 (贵州大学 动物科学学院，贵州 贵阳 550025) [摘 要]应用RT—PCR技术对贵州省不同时期不同禽源 NDV分离株 (肉鸡源 P1株与 BY株、蛋鸡源 H2株与FW株 、七彩山鸡源N98株、越南斗鸡源DQ株 、鸵鸟源TN株及鸽源GZ株)F蛋白基因进行扩增、 克隆和测序分析，结果表明：8株 NDV贵州分离株 F基 因长度均为 1662bp，可编码 553个氨基酸 ；NDV贵 州分离株间核苷酸同源性为 84。0 ～99．7 ，氨基酸同源性为 87．5,04～99．3 ；与国内外NDv参考毒株 (LaSota株、B1株、F48E9株、CH2000株和 Tw2000株)的核苷酸同源性为84．2 ～98．9 ，氨基酸同源性 为 87．2 ～98．6 ；GZ株和 TN株为基 因II型，DQ株、N98株、P1株和 H2株为基 因V1I型(均为Vlid亚 型)，BY株和 FW株为基因IX型。表 明，不同时期NDV贵州分离株的基因型不同，近年流行的ND疫情主 要是 由基 因VII型 NDV 引起 ，与国 内其他省市ND流行趋势基本一致 。 [关键词]新城疫病毒；F基因；序列分析；基因型；贵州 [中图分类号]$851．3 [文献标识码]A MolecularEpidemiologyStudyOl3NewcastleDisease VirusinGuizhouProvince GAO Ying，YINJun—lei，WU Xiang—long，ZHOU Bi-jun，WENMing ，WENGui—lan (AnimalScienceCollegeofGuizhouUniversity，Guiyang，Guizhou550025，China) Abstract：Thefusionproteingene(F gene)ofeightisolatesofNewcastlediseasevirus(NDV)，which isisolated from differentavian in differentyearsin Guizhou province．wereamplified usingRT—PCR technique，thenwereclonedrespectivelyintothepMD18一T vectorandsequenced。andtheseF genewere analyzedwithreferenceNDV stainsinGanBank．TheresultsshowedthatFgeneofallisolatesare1662bp encoding553amino acids，and the sequence identitymatrix indicated thatthehomology ofnucleotide sequenceoftheseisolatesare84．0 ～99．7 and thatofaminoacidsequenceare87．5 ～ 99．3 ，and theyarerespectively84．2 ～ 98．9 and87．2 ～ 98．6 comparedwiththatofLasota，B1，F48E9， CH2000andTW2000．ThephylogeneticanalysisshowedthatstrainDQ。N98。P1andH2belongedto VIIgenotype，strainBY andFW to IX genotype，and strain GZ and TN to IIgenotype．Theresults revealedthatthegenotypeofNDV had transformed in differentyears。and VIIgenotype isthemain geno