大麦黄矮病毒PAV河南分离物通读蛋白ORF5基因的分子特征分析.pdf

第44卷 第 5期 河 南 农 业 大 学 学报 Vo1．44 No．5 2010年 l0月 JournalofHenanAgriculturalUniversity 0ct． 20lO 文章编号：1000—2340(2010)05—0566—06 大麦黄矮病毒 PAV河南分离物通读蛋 白 ORF5基因的分子特征分析 王 阳 ，刘 艳 ，王锡锋 ，李志忠’ (1．兰州理工大学生命科学与工程学院，甘肃 兰州 730050； 2．中国农业科学院植物保护研究所国家病虫害生物学重点实验室，北京 100193) 摘要 ：利用RT—PCR从河南各地采集的 110份小麦病样上鉴定出28个大麦黄矮病毒 (Barleyyellowdwarfviruse。 BYDV)PAV分 离物 ，并获得 了这 28个分离物的通读蛋 白(Readthroughprotein，RTP)ORF5基 因全 长．通过氨基 酸序列比对可知 ，河南分离物 一ORF5基 因变异普遍较大，28个 BYDV．PAV河南分离物 RTP．ORF5基 因之 间 的核苷酸序列一致性为75．9％ ～100％，氨基酸序列一致性为79．4％ ～99．8％，核苷酸和氨基酸的一致性变异 都较大．与 国内外报道的 l6个 BYDV—PAV通读蛋 白基 因相比对 ，其核苷酸序列一致性为72．2％ 一99％，由此推 导的氨基酸序列一致性为77％ ～99．6％．系统进化分析显示河南地 区分离物在4个 内组群 中都有分布．这些数 据说明河南的大麦黄矮病毒 PAV多样性丰 富． 关键词 ：大麦黄矮病毒 ；通读蛋 白；系统进化分析 ；多样性 中图分类号 ：$435．121 文献标志码 ：A AnalysesofmolecularcharacteristicsontheORF5geneofreadthrough protein ofbarleyyellow dwarfviruses-PAV isolatedfrom Henan WANG Yang一，LIU Yan ，WANG Xi．feng ，LIZhi．zhong。 (1．CollegeofLifeScienceandEngineering，LanzhouUniversityofTechnology，Lanzhou730050，China； 2．StateKeyLaboratoryforBiologyofPlantDiseasesandInsectPests，InstituteofPlantProtection， ChineseAcademyofAgriculturalSciences，Beijing100193，China) Abstract：28 isolatesofBYDV—PAV weredetectedbyRT-PCR from 110 infectedwheatplantswhich werecollectedrfomHenanProvince．TheORF5genesofReadthroughprotein(RTP)oftheseisolates weresequenced and analyzed．The identitiesofORF5 genebetween the28 isolatesofBYDV—PAV were75．9％ ～100％ on nucleotideacidsand79．4％ 一99．8％ onaminoacidsrespectively．When theobtainedsequencedatawerecompared withpreviouslyreposedsequencesof16 BYDV-·PAV iso-· lateshomeandabroad．theresultsshowedthattheidentitiesofORF5genewere72．2％ ～99％ onnu- cleotideacidsand77％ ～99．6％ onami