人乳头瘤病毒16阳性与人乳头瘤病毒阴性食管癌的基因表达谱研究.pdfVIP

中华胃肠外科杂志2011年9月第 14卷第9期 ChinJGastrointestSurg，September2011，Vo1．14，No．9 ． 论 著 ． 人乳头瘤病毒 16阳性与人乳头瘤病毒阴性 食管癌的基因表达谱研究 沈娜 刘英 王其艳 师晓天 路常东 柯杨 【摘要】 目的 探讨人乳头瘤病毒(HPV)感染在食管癌的发生发展中可能存在的分子机制。 方法 采用 PCR的方法检测食管癌患者中HPv的感染状况及型别 ．筛选出8例 HPV 16阳性和 7例HPV阴性的食管癌组织样本．进行solexa测序及生物信息分析。结果 HPV16阳性患者中共 筛选出796个差异基因．其中366个基因上调 。430个基因下调。对差异基因进行功能分类和通路 分析 ．发现这些差异基因主要涉及肿瘤发生、免疫和炎性反应 、细胞生长增殖以及细胞运动等方面， 其中以免疫炎性反应的因子最具代表性 结论 免疫因子的差异可能与食管癌中的HPV感染及作 用存在一定关联。 【关键词】 人乳头瘤病毒 16型；食管肿瘤； 基因表达； Solexa测序；免疫炎性因子 Geneexpression profiling studyofHPV-16 positiveand IⅡ．v-negativeesophagealsquamouscell carcinoma SHENNa，LIUYing，WANGQi-yah，SHIXiao—tian，LUChang-dong，KEYang．‘Key LaboratoryofCarcinogenesisand TranslationalReserach (MinsitryofEducation)，Departmentof Genetics，PekingUniversitySchoolofOncology，BeringCancerHospitalInstitute，Beijing100142， China Correspondingauthor：KEYang，Email：keyang@bjmu．edu．cn ． A【bstract】Objective Tostudythedifferenceingeneexpressionbetweenhumanpapillomavirus (HPV)16一positiveandHPV-negativeesophagealsquamouscellcarcinoma(ESCC)．Methods EightHPV 16-positiveand seven HPV·negativeESCC specimenswere evaluated byPCR．Thesampleswel~then determined for gene expression profiling using Solexa Sequencing Chip followed by bioinfomr atics analysis．Results A total of796 differentially expressed genesbetween HPV 16-positive and HPV- negativeESCC wereobserved．Among them，366wereup·regulatedwhile430weredown—regulated． Functional classification and pathway analysisshowed thatthefunctionsofthesegenesweremostly relatedtotumormorphology，immune，and inflammatoryresponse，cellulargrowth andproliferationna d cellulra movement．Ofthese，factorsrelated toimmune nad infl ammation werethemostrepresentative． Conclusion Differencesin immunologicfactors may be associated with HPV infection in esophageal cancer· K【eywords】 Humanpapillomavirus16(HPV16)；Esophagealneoplasms；