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病毒 蛋白的计算机模拟的初步研究
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陈彦涛 罗钟琳 丁建东
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复旦大学高分子科学系 聚合物分子工程教育部重点实验室 上海
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摘要 以粗粒化的多肽链模型进行了 病毒包膜中 蛋白的计算机模拟 描述了该蛋白质空间构象的
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概貌 首先扩展了多肽链的 模型 使之能够用于研究在水或脂环境下蛋白质折叠的行为 并且考虑了全
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部氨基酸残基疏水相互作用能的差异 相关格子链的 模拟显示了很高的计算效率 模拟再现了
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蛋白质的 转变 验证了蛋白质序列分布的重要性 结果表明 在水环境中 蛋白质空间结构由
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紧致的疏水内核和部分向外延伸的亲水片段组成 在脂环境中 中部疏水片段会成为向外延伸的环 而当两
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侧紧致的亲水片段分开时 则形成桥
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关键词 蛋白质折叠 计算机模拟 高分子构象统计 冠状病毒 生物信息学
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中图分类号 CD*D0) 文献标识码 - 文章编号 (’EF(GD(’((*+(HF)(I()
自 年底非典型性肺炎 简称 突发以来 相关研
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究在世界范围全面展开ZF[ )\ 随着几个 菌株基因组序列的公布 人们可以根据已有的生物信息
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学 知识很快地预测该病毒中蛋白质的个数和氨基酸序列 病毒是一个有包膜的
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单链 病毒 其
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