利用脉冲场凝胶电泳测定东湖浮游病毒基因组的大小.pdfVIP

( ) 第 5 1 卷 第 S2 期 武汉大学学报 理学版 Vol . 5 1 No . S2 　 　2005 年 12 月 J . Wuhan U niv . (Nat . Sci . Ed . ) Dec . 2005 ,238～240 文章编号 :167 18836 (2005) S2023803 利用脉冲场凝胶电泳测定东湖 浮游病毒基因组的大小 刘艳鸣 , 张奇亚 ( 中国科学院 水生生物研究所/ 淡水生态与生物技术国家重点实验室 ,湖北 武汉 430072) 　　摘 　要 : 采用脉冲场凝胶电泳 ,对东湖水样中的浮游病毒基因组大小进行了测定 ,显示 5 条主要核酸带 ,其大 小分别为 20 、50 、100 、150 和 250 kb , 以20～60 kb 的核酸带为强 ,而这符合噬菌体和噬藻体的基因组主要范围 ,进 一步证实东湖浮游病毒的优势类群为噬菌体和噬藻体. 关 　键 　词 : 浮游病毒 ; 基因组 ; 脉冲场凝胶电泳 中图分类号 : Q 939 . 4 ; Q 179 . 2 　　　文献标识码 :A 0 　引　言 材料与方法 1 　 　　已有研究结果显示浮游病毒是水体微生物群落 1 . 1 　水样的采集 丰度最高的活性成分 , 比细菌丰度高[ 1 ] ,它可通过裂 2005 年 3 月 2 日上午 9 点至 11 点在东湖两个 解水生微生物群落中的优势种群来调节水体中微生 ( ) ( 不同的采样站 ,A 站 位于郭郑湖 和 B 站 位于汤 物的物种多样性 、种群分布和群落结构 ;影响碳和营 ) 林湖 进行采样. 采样时的温度范围为 7 . 5～10 ℃. 养物质的流动 , 进而影响生物地化循环和全球气 把取样器浸入水面 以下 10 cm 处取出水样 , 装入 候 [2～5 ] ,另外 ,浮游病毒还可通过转导 、转化和溶源 100 mL 收集瓶内. 转换的方式介导水生态系统中微生物之间的基因转 1 . 2 　脉冲场凝胶电泳样品的制备及电泳 换 ,在遗传水平上影响水生微生物群落的种群多样 参照J iang 等 [ 13 ] 的方法 ,稍作修改 ,主要步骤 性 [ 6～9 ] . 因此浮游病毒对水环境乃至整个生态系统 如下 : μ 都具有重要影响. 样品分离与浓缩 取回的水样先用 0 . 22 m 的 借助现代分子生物学技术和方法 ,可以测定浮 膜过滤 ,去除浮游细菌等 ; 然后每个取样点取 100 游病毒的基因组大小 ;还可通过检测浮游病毒的保 mL 水样 , 用 Beckman L90k 超速离心机