菊芋SSRPCR反应体系优化及3个品种的分子鉴别.pdfVIP

2013年26卷6期 西南农业学报 VoL26 Nn6 S伽th陀砒CIlimJ01哪lof scienc∞ 2441 A画cultural 文章编号：1001—4829(2013)06—2441一06 任鹏鸿，韩睿，马胜超，李莉+ (青海省农林科学院菊芋研发中心，青海省蔬菜遗传与生理重点实验室，青海西宁810016) 摘要：本研究通过单因子优化试验和L16(45)正交试验设计的方法，对菊芋SSR．PCR反应体系进行优化。结果表明，20出最佳 m彬L mmoL／L u 反应体系：10×PcR扩增缓冲液，2．5 M矿+，o．20 dN低，o．30岬loL／L正反引物，o．27’叼DNA聚合酶和50rIg模 板DNA。利用该优化体系，从100个SSR引物组合中筛选出12个清晰且多态性高的引物组合对3个品种的菊芋DNA序列进行 扩增，得到58个位点，其中多态性位点39个，多态率为67．2％；建立3个菊芋品种分子识别卡，用2对引物组合的6个多态性位 点即可将其分开。本研究为后续应用sSR分子标记技术对菊芋进行种质资源分子遗传学方面的研究提供依据。 关键词：菊芋；sSR·PcR；优化；引钧筛选；分子鉴别 中图分类号：s632．3 文献标识码：A ofSSR-PCR Optin血ation Reac廿佃System锄d Anichoke Jelllsalem Thr∞Sampl姻0f 肛N Li‘ Peng·hollg，HAN胁，MASh蛐g．c}Iao，U cent盯oftlIe of A∞demy0f埘clIlh鹏and Jem8alem (Qindlai Fo咖Re8e眦h明dDe砌opl呲nt amchoke，Qing}laiIJab0哦oryVe铲ta- bleGenetics¨d Physiolo盯，Qing}IaiXiniIIg810016，Cllim) Ab心act：SSR-PCR眦cd帆8y8t锄0fJ哪sal啪anichoke t}Ie testand tIli8 w∞叩dmizedby 8ingle‰toronII昭mald髓酒in paper．ne 瑚Illt8howedthat of lo×PcR mm∥L mm彬L the叩dm8lPCR(20一)IIli)【tllT|e咖tainedbu如r，2．5 M92+，o．20 of帅8，o．30 u 50 out 岬oL／L0fforw8rd趴d聊e瑚面m啪眦h，O．2of7幻DNA叫yIIlem∞趴dng0ftemplaIeDNA；u8ing叩6IIli五ng8y8tem，12 of100 ofssR wIIich 8Itichoke obtained58 pairs prime玛骶糟8cr∞ned伽t，埘t11thr∞s跚