微生物教程yyd第十一章微生物的分类和鉴定.pptVIP

前言 第一节　通用分类单元 第二节　微生物在生物界的地位 第三节　各大类微生物的分类系统纲要 第四节　微生物分类鉴定的方法 第一节 通用分类单元 一、种以上的系统分类单元 （一）七级分类单元 　　界（Kingdom）、门（Phylum）、纲（Class）、目（Order）、科（Family）、属（Genus）、种（Species），在以上七个主要级别中，当必要时都可补充若干辅助单元，包括加上“亚”、“超”或添上“族”等。 （一）双名法 　　双名法指一个物种的学名由前面一个属名和后面一个种名加词两部分构成。属名的词首须大写，种名加词的字首须小写（包括由人名或地名等专用名词衍生的）。出现在分类学文献中的学名，在上述两部分之后还应加写三项内容，即首次定名人（正体字，用括号括住）、现名定名人（正体字）和现名的定名年份。如在一般书刊中出现学名时，则不必写上后3项内容。 （二）三名法 　　　当某种微生物是一个亚种或变种时，学名就应按三名法拼写。 　　　学名=属名+种名加词+符号subsp或var+亚种或变种的加词 　　　属名和种名加词排斜体，符号subsp或var排正体可省略，亚种或变种的加词排斜体不可省略。 　　　如酿酒酵母椭圆变种（椭圆酿酒酵母） 　Saccharomyces cerevisae（var）ellipsoideus （三）有关学名的其它知识 　1、属名 　　　是一个表示该微生物主要特征的名词或用作名词的形容词，单数，第一个字母应大写。其词源可来自拉丁词、希腊词或其它拉丁化的外来词，也有以组合的方式拼成。当前后有两个或更多的学名连排在一起时，若他们的属名相同，则后面的一个或几个属名可缩写成一个、两个或三个字母，在其后加上一个点。如Bacillus（芽孢杆菌属）可缩写成“B.”或“Bac.”等。 三、种以下的几个分类名词 　　　亚种以下的分类单元很多，它们的提出和使用均不受“国际命名法规”的限制。 （一）亚种（subspecies,subsp,ssp.） 　　　亚种是进一步细分种时所用的单元，一般指除某一明显而稳定的特征外，其余鉴定特征都与模式种相同的种。其命名方法按“三名法”处理。 第二节 微生物在生物界的地位 一、生物的界级分类学说 （一）两界系统 　　　在距今两千多年前我国的的典籍就有记载，在国外，亚里斯多德于公元前4世纪时也提出过生物可分动物和植物的观点。真正科学地描述两界系统的学者是瑞典博物学家林奈，他在其名著《植物种志》（1753年）中首先提出了动物界和植物界两界系统。 二、三域学说 　　　20世纪70年代末由于美国伊利诺斯大学的C.R.Woese等人对大量微生物和其它生物进行16S和18SrRNA的寡核苷酸测序，并比较其同源性水平后，提出了一个与以往各种界级分类不同的新系统，称为三域学说。“域”是一个比界更高的界级分类单元，过去曾称原界。三个域指的是细菌域、古生菌域和真核生物域。与其他系统的最大差别是把原核生物分成了两个有明显区别的域，并与真核生物一起构成整个生命世界的三个域。 　 　附：几个重要的真菌分类系统的比较图 第三节 各大类微生物的分类系统纲要 　　《伯杰氏手册》最早成书于1923年，第一版名为《伯杰氏鉴定细菌学手册》，主要编者为美国学者D.Bergey等人。此后由其它学者不断修订，从1974年的第八版起，编写队伍进一步国际化和扩大化，至1994年已出至第九版。1980年代初起，书名改为《伯杰氏系统细菌学手册》。《伯杰氏系统细菌学手册》分为五卷出版，内容极其丰富。手册把原核生物分为古生菌界和细菌界，相当于三域学说中的两个域。古生菌界共包括２门、5组、 ８纲、１１目、１７科和６３属，共２０８个种；而细菌界包括１６门、 26组、 ２７纲、６２目、１６３科和８１４属，共有４７２７个种。 第四节　微生物分类鉴定的方法 　　　通常可把微生物的分类鉴定方法分成４个不同水平： 　　　１、细胞的形态和习性水平，例如用经典的研究方法，观察微生物的形态特征、运动性、酶反应、营养要求、生长条件、代谢特性、致病性、抗原性和生态学特性等。 　　　２、细胞组分水平，包括细胞壁、脂类、醌类和光合色素等成分的分析。 一、微生物分类鉴定中的经典方法 　　　不管鉴定哪一类微生物，其工作步骤都离不开以下三项： 　　　①获得该微生物的纯培养物； 　　　②测定一系列必要的鉴定指标； 　　　③查找权威性的菌种鉴定手册。 二、微生物分类鉴定中的现代方法 （一）通过核酸分析鉴定微生物遗传型 １、DNA碱基比例的测定即G和C所占的摩尔百分比，这是目前发表任何微生物新种时所必须具备的重要指标。 ２、核酸分子杂交法 　　　　是测定核酸分子同源程度和不同物种间亲缘关系的有效手段。 　２、Enterotube系统 　 　　由8~12个分隔