大仓鼠，黑线仓鼠，黑线姬鼠及社鼠线粒体DNA控制区全序列SNP分析.pdfVIP

大仓鼠、黑线仓鼠、黑线姬鼠及社鼠线粒体DNA控制区全序列sN甲分析 摘要 本研究通过克隆与测序线粒体控制区全序列，采用单核苷酸多态性 (SNP)技术对河北、北京地区大仓鼠，山东地区黑线仓鼠、黑线姬鼠与 社鼠种群的遗传多态性进行了研究，探讨了不同地理大仓鼠种群，黑线仓 鼠、黑线姬鼠与社鼠种群遗传结构分布的形成原因，并对其之间的序列变 异水平进行分析。主要研究结果如下： 1．通过对河北省饶阳县、顾安县、北京市顺义县大仓鼠线粒体控制 区sNP的比较分析，结果表明顾安县与顺义县大仓鼠的线粒体控制区的核 苷酸变异频率只有O．01％，而饶阳县与顾安县、顺义县大仓鼠的核苷酸变 异频率分别高达17．3％、17．4％。在地理位置上，由于饶阳县与顾安县、顺 义县相隔较远，加上河道阻隔，使得不同地区的大仓鼠种群在长期的地理 隔离和片段化生境中缺乏基因交流，逐渐形成了本地区特有的基因类型。 2．通过对山东地区黑线仓鼠种群、黑线姬鼠种群及社鼠种群线粒体 控制区sNP的比较分析，结果表明该地区黑线仓鼠、黑线姬鼠及社鼠各个 种群的遗传结构相对单一，进化速度较慢，各鼠种的核苷酸变异频率均低 于0．01％。其中原因可能是少有外来物种入侵造成了同一地区种群之间亲 缘关系较近。 3．由大仓鼠、黑线仓鼠、黑线姬鼠、社鼠线粒体控制区全序列比较 图谱推论线粒体控制区全序列约200～600bp段最为保守，进化速率较慢， 适于鼠类系统进化分析。 关键词：大仓鼠，黑线仓鼠，黑线姬鼠，社鼠，线粒体控制区， 遗传多态性，单核苷酸多态性(sNP)，系统进化 I 大仓鼠、黑线仓鼠、黑线姬鼠及社鼠线粒体DNA控制区全序列sNP分析 Abstract ln the stnlctureof this meTat—like studygenetic hamsteI(crfcemfW fromtl露elocationsin Hebei andthechinese 护讲讲1) province the field stripedmouse坳d踟“sng阳rfH曲， hamster(cJrfc已m厶塔6口r口6已月5f)， thealinesewhIB-bellied twolocationsin Rat(mrms，l如如册把)f如m of Provi孵wereevaluatedSNP thefull of Shandong by analysis sequences mitoclIondrial distaIlcesand D量酿(mtDNA)contmlre西on．Thegenctic mesefour werecalculatedaIldthe pero朗tsimilariti薯among印ecies ontheircontrol were Based homologousseq嘲ces compared． re百on thcmolecular treewasconstnlcted sequences，