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白血病淋巴瘤患者分子遗传学异常与预后相关性研究 中文摘要 白血病淋巴瘤患者分子遗传学异常与预后相关性研究 中文摘要 第一部分 急性粒细胞白血病患者转录组研究 目的 （1）筛选和鉴定急性粒细胞白血病M2 型不同发病阶段差异表达的基因， 并对差异表达基因做GO 功能分析和KEGG Pathway 分析，了解差异表达基因的生物 学功能，确定其参与的最主要生化代谢和信号转导途径。（2 ）通过将急性粒细胞白血 病M2 型不同发病阶段的转录组序列与人类参考基因组进行比对，分析并筛选发病相 关的单核苷酸多态性位点及融合基因。 方法 通过高通量测序的方法对一例正常核型急性粒细胞白血病（AML-M2 ）患 者初诊时及缓解后外周血样本进行转录组测序，应用TopHat 和Bowtie 软件进行读段 在人类参考基因组及转录组上的定位，运行Cuffdiff 程序计算转录本丰度和差异表达 基因，运行DAVID 程序对差异表达基因进行GO 和KEGG 通路的注释和富集分析； 对白血病相关基因JAK1 、JAK2 、TET2、ASXL1 、IDH2 、WT1 、BCR 、ABL1 、JAK3 、 GATA2、HOXA9 、FLT3 、IDH1 表达情况进行筛选分析；利用BWA 和varscan 两个 软件进行SNV 筛选。通过对初诊时和缓解后表达基因的比较，筛选可能与白血病发 生相关的单核苷酸变异（SNV），对这些突变进行分子功能及代谢通路分析。 结果(1)通过对发病期及缓解期表达基因比较，筛选到 4148 个差异表达基因 （FDR0.05 ），其中上调差异基因1336 个，下调差异基因2812 个。差异表达基因富 集于140 个GO 术语和26 个KEGG 通路，主要与免疫反应、信号转导相关。其中白 血病相关基因 WT1 、BCR 、ABL1 、JAK3 、GATA2、HOXA9 、FLT3 、IDH1 为差异 表达基因。(2)通过SNV 分析最终获得11 个突变基因（p0.05 ），包括ZRSR1 、MLXIP 、 TLN1、LAP3 、HK3 等。 结论 (1)RNA-Seq 为我们提供了急性白血病患者体内基因表达谱，通过 1 例 AML-M2 患者的治疗前和完全缓解后转录组比较分析研究，发现了白血病患者异常 表达基因，为进一步探索AML 的发病机制提供了新的线索。（2 ）急性白血病的发生 和发展与患者体内的多种基因异常有关，可以表现为获得性突变(MLXIP 、HK3 、 I 中文摘要 白血病淋巴瘤患者分子遗传学异常与预后相关性研究 TLN1、ICAM-3) 、差异表达（WT1 、BCR 、ABL1 、JAK3 、GATA2、HOXA9 、FLT3 、 IDH1 ）、形成融合基因等多种形式。除了目前已知的基因异常外还有更多的基因表达 异常尚未能被充分认识。 关键词 急性白血病 高通量测序 基因表达 单核苷酸变异 转录组 第二部分 BCL6 、MYC 、P53 基因异常对弥漫大 B 细胞淋巴瘤预后的影响 目的 探讨BCL6 、MYC 、P53 基因异常对弥漫大B 细胞淋巴瘤（diffuse large B-cell lymphoma，DLBCL ）患者预后影响，筛选DLBCL 独立的预后因素，为DLBCL 患者 临床预后判断及分层治疗的选择提供依据。 方法 收集我院2009 年-2012 年有完整随访资料的新诊断的DLBCL 患者的病理 标本65 例，采用间期荧光原位杂交技术（interphase fluorescence in situ hybridization, I-FISH ）分别检测患者标本肿瘤细胞BCL6 、MYC 重排、P53 缺失情况，并结合临床 指标及免疫组化结果进行多因素生存分析。 结果 1.BCL6 重排率为21.5% （14/65），P53 缺失率为35.4% （23/65 ），MYC 重排率为7.7