烟草疫霉侵染前后剑麻叶片转录组学研究_汪平.docVIP

热 带 作 物 学 报 2014， 35（3）： 576-582 Chinese Journal of Tropical Crops 烟草疫霉侵染前后剑麻叶片转录组学研究  汪  平 1，2， 高建明 2， 杨  峰 2， 郑金龙 3 刘巧莲 2， 陈河龙 2， 易克贤 3 ＊  1 海南大学环境与植物保护学院， 海南海口  570228 中国热带农业科学院热带生物 技术 研究所 2 农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室  海南海口  571101 中国热带农业科学院 环境 与 植 物 保 护 研究所 3 农业部热带作物有害生物综合治理重点实验室  海南海口  571101  摘  要  为 克 隆 剑 麻 受 斑 马 纹 病 病 原 菌 烟 草 疫 霉 侵 染 后 的 应 答 基 因 ， 以 病 原 菌 侵 染 前 后 的 剑 麻 H.11648 叶 片 为 材 料 ， 构 建 剑 麻 转 录 组 Unigene 数 据 库 ； 组 装 得 到 非 冗 余 Unigene 131 422 个 ， 其 中 ， 500~1 000 bp 的 Unigene 占 总 数 65.39％， Unigene 的 数 量 随 其 长 度 递 减 。 GO 分 类 分 析 发 现 ： 在 得 到 的 所 有 Unigene 中 ， 注 释 到 生 物 过 程 的 基 因 最 多 （152 835）； 细 胞 组 分 其 次 （129 197）； 参 与 分 子 功 能 的 最 少 （47 420） 。 KEGG 代 谢 通 路 分 析 将 剑 麻 转 录 组 unigene 分 成 128 类 ， 其 中 ， 参 与 生 化 代 谢 通 路 的 Unigene 最 多 ， 有 9 354 个 ， 占 总 数 27.09％ ； 参 与 植 物 - 病 原 互 作 代 谢 通 路 的 基 因 有 1 795 个 ， 占 总 数 5.2％。 基 因 表 达 丰 度 RPKM 值 显 示 上 调 基 因 9 415 个 ， 下 调 基 因 28 980 个 ， 其 中 参 与 病 原 互 作 的 基 因 占 680 个 。 关键词 烟草疫霉 ； 侵染 ； 剑麻 ； 转录组 中图分类号 S563.8 文献标识码 A  Transcriptome of Sisal Leaf Pretreated with Phytophthora nicotianaeBreda. WANG Ping1,2, GAO Jianming2, YANG Feng2, ZHENG Jinlong3 LIU Qiaolian2, CHEN Helong2, YI Kexian3 ＊ 1 College of Environment and Plant Protection, Hainan University, Haikou, Hainan 570228, China 2 Key Laboratory of Biology and Genetic Resources of Tropical Crops, Ministry of Agriculture / Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences, Haikou, Hainan 571101, China 3 Key Laboratory of Integrated Pest Management on Tropical Crops, Ministry of Agriculture / Institute of Environment and Plant Protection, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences, Haikou, Hainan 571101, China Abstract Sisal leaves infected with Phytophthora nicotianaeBreda were used to construct the transcriptome to study the response gene of sisal infected by P. nicotianaeBreda.． Among the 131, 422 nonredundant unigenes, 65.39% were between 500-1 000 bp, indicating that the number of unigenes was