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第 55 卷 第 10 期 化 工 学 报 Vol 55 №10
( )
2004 年 10 月 Journal of Chemical Industry and Engineering China October 2004
综述与专论 生物信息学用于代谢网络
研究的进展与展望
1 1 ,2 1 1 1 ,2
何 锋 马红武 赵学明 元英进 曾安平
(1 天津大学化工学院 , 天津 300072 ;
2 GBFGerman Research Center for Biotechnology , Mascheroder Weg 1 , 38124 Braunschweig , Germany)
摘 要 如何分析基因测序和高通量分析方法所获得的海量数据和信息 , 及由此而得到的复杂生物网络 , 是生
物信息学研究者所面临的重要任务. 本文综述了基于基因组的大规模代谢网络重建和分析的进展 , 论述了利用
生物信息学方法分析代谢网络结构的主要方法和结果 ; 比较了现阶段两种最常用的代谢途径分析方法, 即基元
模式和极端途径的差异 ; 列举了这两种方法在代谢网络结构和功能分析、工程菌设计等多方面的重要应用 ; 指
出了现阶段在途径分析领域存在的问题和应对的策略.
关键词 生物信息学 基因组学 代谢网络 代谢途径 基元模式 极端途径
中图分类号 TQ 9201 Q 8114 文献标识码 A 文章编号 0438 - 1157 (2004) 10 - 1593 - 09
PRO GRESS AND PERSPECTIV E IN APPL ICA TION OF
BIOIN FORMA TICS TO ANAL YSIS OF M ETABOL IC N ETWOR KS
HE Feng1 , MA Hongwu1 ,2 , ZHAO Xueming1 , YUAN Yingjin 1 and ZEN G Anping1 ,2
(1 School of Chemical Engineering and Technology , Tianjin U niversity , Tianjin 300072 , China ;
2 GB FGerm an Research Center f or Biotechnology , M ascheroder Weg 1 , 38124 B raunschweig , Germ any)
Abstract One of the challenges of contemporary bioinformatics is how to make use of the large volume of data
and
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