一种优化的植物组织RNA原位杂交技术AOptimizedinSituRNAHypridizationTechniqueinPlantT.pdfVIP

一种优化的植物组织RNA原位杂交技术AOptimizedinSituRNAHypridizationTechniqueinPlantT.pdf

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遗传HEREDITAS(Beijing)20(3):27一301998 ·实 验 技 术 与 方 份乡 · 一种优化的植物组织RNA原位杂交技术① 陈绍荣 毕学知 吕应堂 杨弘远 武(汉大学生命科学学院,武汉430072) AOptimizedinSituRNAHybridizationTechniqueinPlantTissues CHENShaorong BIXuezhiLuYingtang YANGHongyuan (CollegeofLifeScience,WuhanUniversity,Wuhan430072) RNA-RNA原位杂交技术以其RNA探针的标记效率高、通透性强、结合稳定、杂交信号强等优势,己被 广泛应用于植物和动物组织的基因时空表达研究川 。RNA探针的标记物有放射性和非放射性两种类型。以 前,人们多采用放射性标记探针。近年来,因非放射性标记探针的安全、稳定、省时和操作方便而被越来越多的 研究者所接受 .〔,。国内RNA原位杂交技术在动物组织中应用比较广泛,但在植物组织中的应用尚未见报 道。我们参考有关文献4-〔8),利用地高辛d(igoxigenin)标记的钙调素反义RNA探针,检测水稻雌蕊中钙调素 mRNA的空间分布和表达水平,获得明显的阳性反应.在实验过程中,我们根据植物组织的特点,对一些操作 步骤进行必要的取舍和修改,从而建立了一种优化的植物组织RNA原位杂交技术。 1材 料 和 方 法 操作过程应尽量避免RNase污染,耐高温器皿 180℃烘烤 8h以上,其它器皿用氯仿冲洗,溶液用0.1%焦 碳酸二乙酷(DEPC)处理或DEPC-H2O(DEPC处理过的蒸馏水)配制,DEPC是一种RNase强烈抑制剂。 1.1材料 水稻归rvzasativaL.)晚梗931开花前后雌蕊用FAA(10%甲醛、50%乙醇、3%冰乙酸)固定,常规酒精 系列脱水与石蜡切片,切片厚度 lOpm, 钙调素cDNA由Sasaki等分离c8),日本NIAR(NationalInstituteofAgrobiologicalResources)和 STATF(InstituteoftheSocietyofTechno-InnovationinAgriculture,ForestryandFisheries)水稻基因组研究计 划 J(apaneseRiceGenomeResearchProgram,RGP)Nagamura博士提供,长度为0.8kb,克隆在pBluescriptII SK+质粒中,克隆位点为Notl/Sall,两端分别有T3和T7RNA多聚酶启动子.按常规方法 ’〔。,转化、扩增和 提取质粒,受体菌株为大肠杆菌TG1. Noil和SaII内切酶、T3和T7RNA多聚酶以及地高辛标记检测试剂等分别购自B.M公司、Promega公司 和Sigma公司。 1.2制片 载玻片在洗液中过夜,充分清洗后经180*C烘烤8h以上,在含 100lig/ml多聚赖氨酸的10mmol/L Tris-HCI(pH8.0)中室温浸泡30min,室温晾千;切片用DEPC-H20-45℃展片、贴片,401C烘烤过夜。 1.3质粒DNA线性化 质粒 10gR,lox消化缓冲液 10川,无菌水定容到 100u1,加Sall或Nod20单位,37℃保温 2h以上。消 ①国家自然科学基金资助的项目. 28 遗 传HEREDITAS(Beijing)1998 20卷 化液用酚:氯仿(1(:1),氧仿各抽提一次,每次1,1000xg,4C离心5min,上清液用0.1倍体积3mol/L乙 酸钠 p(H5.2)和2倍体积乙醇沉淀过夜,11000xg,4℃离心20min,70%乙醇洗涤一次,真空干燥.将线性化 质粒cDNA按1pg/川重悬于DEPC-H20中,-20℃以下保存,并取2川点样电泳,检测线性化纯度。 1.4地高辛标记的体外转录 在冰上按顺序加人线性化质粒DNA1pg,2plNTP标记混合物,2pl10x转录缓冲液,lplRNase抑制剂 2(0 单位 /pl).DEPC-H20定容至18川,2plT3或T7RNA多聚酶 (20单位/p1),轻轻混匀和离心后,371C保温2h, 加人2p1无RNase的DNasel后,37℃保

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