水稻条纹病毒RNA4基因间隔区序列分析――混合侵染及基因组变异证据.pdfVIP

卷 期 ! # 微 生 物 学 报 ’() *! 1( *# 年 月 $%% % !#$ %’()(*(+$ ,-$ +,-(./0 $%% !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!! 水稻条纹病毒!#$ 基因间隔区序列分析 ———混合侵染及基因组变异证据 魏太云 林含新 吴祖建 林奇英 谢联辉 （福建农林大学植物病毒研究所 福州 #%%%$ ） 摘 要：克隆和测定了我国水稻条纹病毒（ ） 个分离物 基因间隔区（ HI’ $$ H1J! KD-/0L/D=, 0/6 L=(D， ）序列，序列比较结果表明，我国 在长度上存在 、 及 种 KH HI’ H1J! KH 5!.M 5#!.M 2$.M 不同的类型，其中 种不同类型的序列在云南省均有存在，而在其它省份仅存在 类型 5#!.M 的序列，云南省还存在不同片段类型序列在同一分离物中混合侵染的现象。序列内部具有两 个重要的结构特征，一是具有插入序列；二是有两处反向重复序列，可形成两个明显的发夹结 构，其中一个序列比较保守，形成的发夹结构稳定；但另一个发夹结构由于碱基变异导致其稳 定性在各个分离物中差异较大。本论文还讨论了插入片段特性、不稳定的发夹结构的形成最 低自由能及病毒致病性分化的关系。 关键词：水稻条纹病毒， 基因间隔区，发夹结构 H1J! 中图分类号： 文献标识码： 文章编号： （ ） I!$ N! J %%%65$%7 $%% %#6%#226%7 由水稻条纹病毒（ ， ）引起的水稻条纹叶枯病是当前我国水稻上的 H=,/ O-0=M/ P=0BO HI’ ［］ 一种分布广、危害大的重要病毒病，分布于我国 个省市 。 年的实地调查 5 772 Q $%%$ 表明，该病目前在江苏、河南、山东、云南、北京、辽宁、河北等省市的一些地区仍发生十分 ［］ 普遍$ 。 是纤细病毒属（ ）的代表成员，由介体灰飞虱（ ）以持 HI’ 3/DB=P=0BO !#$%’() *+,-+%.* ［］ 久性方式经卵传播 。 具有独特的基因组结构和表达策略，是研究植物病毒与寄主 HI’ 和介体互作及协同进化机制的模式对象。日本3 分离物的全序列已测定，基因组全长为 ，由 种单链 组成，除