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犬科动物线粒体基因组特征分析术
孟 超 张洪海 z 王 嵬 , 宋曼殳 。一
(1中国科学院研究生院生命科学学院 北京 100049 2曲阜师范大学生命科学学院 山东曲阜 273165
3首都医科大学公共卫生与家庭 医学学 院 北京 100069) O
摘要 在基 因组水平上 ,分析 了已知犬科动物线粒体基 因组的特征 。结果表 明:其基 因排
列顺序相 同;具有 A T含量 高,G含量最低 的碱基偏好性 :存在基 因间隔和基 因重叠;CUA
(Leu),Auu(Ile),AuA(Met)等密码子使用率最高,密码子第 3位 G使用率最低 ;轻链复制起
点序 列组成和二级结构高度保 守 ;在犬、狼 、郊狼控制 区存在 lObp的相似重复序列 ,赤狐序列
差异较大。
关键词 犬科动物 线粒体基 因组 非编码 区
中国图书分类号 :O75 文献标识码 :A
哺乳动物线粒体基 因组呈 闭合环状双链 .长 科)14属 ,但存在争议 。对 GenBank中已测得犬科
度为 16—20kb,包括 22个转运 RNA基因,13个蛋 中犬亚科的犬 (CaMslupusfamiliaris。U96639)]和
白编码基 因,2个核糖体 RNA基因和非编码区.具 狼 (Canislupuslupus,AM711902) ,狐亚科 的赤
有母系遗传 ,缺少重组 ,进化速度快等特征…。 自 狐 (Vulpesvulpes,AM181037)],薮犬亚科 的郊狼
人线粒体基 因组被测定分析以来 ,大量线粒体基 (Canislatrans。DQ480509) 等公开发表 的线粒体
因组被测定 ,截至 2010年 5月 25 日.美 国国家生 基 因组序列的分析 ,以探究犬科动物线粒体基 因
物技术信息中心(TheNationalCenterforBiotechn— 组特征。
ologyInformation,NCBI)的细胞器基因组数据库收 1 犬科动物线粒体基因组特征研 究
集 了2381条完整的线粒体基 因组序列 ,其 中2 1.1 基 因组概况 犬科动物 的线粒体基 因组结
173条来 自后生动物 。我国学者对 同类动物线粒体 构和排列顺序相 同(图 1),基 因排列紧密 ,除了
基因组进行分析 ,获得了鸟类 l2.、爬行类 的线粒 D—Loop区(控制 区)和轻链复制起点存在外 ,其余
体基 因组特征 为基因编码 区。基 因间隔序列较短 ,有基 因重叠 ,
犬科分为 3亚科 (犬亚科 、狐亚科和薮犬亚 不含 内含子 。序列全长在 16kb左右 。
Salmonellatyphim- urium with IL一2 genereducespulmonary
metastases in murine osteosarcoma.Clin O~hop Relat Res,
2008.466(6):1285—1291.
14 LoefflerM.,Le’Negrate G.,KrajewskaM.eta1.Attenuated
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