外周血DNA抽提(酚-氯仿法).docVIP

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外周血DNA抽提(酚-氯仿法) 实验前准备: 融化冻存的血 调水浴锅至56℃。 操作步骤: 新鲜血液 全血离心1300g,15min(或静置) 吸上层白细胞到1.5ml离心管中 加灭菌过的纯水至1.5ml刻度,离心,4℃,4000g,15min 去上层血清,加无菌水1ml溶血 离心4℃,3500g,10min去上清,反复洗血3次。 6、加TES 720ul,RNaseA 5微升,37℃或室温静置20min(消化RNA)。 7、PK(10mg/ml)15ul,56℃消化3-4小时或过夜,直至没有肉眼可见的悬浮物。 ……后续操作从冻存血液操作步骤第5步开始。 冻存血液 1.冻存血室温溶解,取1ml转移至1.5ml离心管。 2. 离心:室温,3500g,15分钟,弃上清,约残留30至50微升。 注意:冻存血融化后会溶血,离心后白细胞沉至管底,呈粘稠的团状,棕红色,与上清的颜色接近,不易分辨,吸除上清的时候动作要缓慢,注意不要吸走白细胞沉淀。 3. 加TES 635微升,RNaseA 5微升,37摄氏度或室温静置20min(消化RNA)。 4. 加PK(10mg/ml)100微升,温和地翻转8次混匀,56度温育过夜(直至没有肉眼可见的悬浮物),不时翻转混匀。 5. 加入等体积(740微升)酚,翻转10分钟混匀。 6. 离心:15000g, 15分钟,吸取上层水相640微升。 7. 加入等体积(640微升)酚, 翻转10分钟混匀。 8. 离心:15000g, 15分钟,吸取上层水相520微升。 9. 加入等体积(520微升)酚-氯仿-异戊醇, 翻转10分钟混匀。 10. 离心:17000g, 15分钟,吸取上层水相400微升。 11. 加入3M 乙酸钠(pH5.2) 40微升(1/10体积),加入880微升(两倍体积)-20℃预冷的无水乙醇 ,翻转20次混匀,会出现白色絮状DNA沉淀。 12. 15000g, 4 ℃ 10分钟,小心的倒掉上清,在吸水纸上扣干残液。 13. 加70%乙醇1ml重悬沉淀,15000g, 4 ℃ 5分钟,小心的倒掉上清,在吸水纸上扣干残液。 14. 再加70%乙醇1ml重悬沉淀,15000g, 4 ℃ 5分钟,小心的倒掉上清,在吸水纸上扣干残液,用无菌棉签搽拭离心管内壁,勿碰到DNA沉淀。 15.打开管盖,室温静置3钟,加纯水30微升-50微升,低速Vortex或用枪吹洗5次混匀,室温静置10分钟。 15.测定浓度和A260/A280,记录,置-20℃保存。 使用此法提取-20℃冻存或4℃短期保存的全血DNA,产率≥20微克DNA/ml全血,A280/A260值大部分在1.80至1.85左右。 试剂的配制: 1. TES: Tris-HCl: 50mM NaCl: 100mM EDTA: 1mM SDS: 0.5% pH: 8.0 2. 无Dnase的胰Rnase (100倍): 最终使用浓度:0.1mg/ml(现加) 。 TIANGEN: RT405 100mg/ml 0.4ml 320元 AMRESCO: 100mg 435元 3. 蛋白酶K溶液的配制(100倍): ?? 用裂解缓冲液配制浓度为10mg/ml。 或用超纯水配制成相同的浓度。最终使用浓度:0.1mg/ml。 AMRESCO(0706):100mg 260元 4. 3M NaAc pH5.2: ?? 1L: 600ml H2O中加入408.24gNaAc 3H2O , 溶解后,用冰醋酸调pH至5.2, 然 后定溶1L ,灭菌。 5. Tris饱和酚(pH8.0)、酚-氯仿-异戊醇均购自Amresco,货号分别为:0945,0883 。 成本总计:14.841元/人份 (QIAamp DNA Blood Midi Maxi 试剂盒成本大约为:170元/人份)

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