蛋白质组学试题整理 - 副本.docVIP

蛋白质组学相关试题及答案 1… Proteome(蛋白质组)：由一个细胞或者组织的基因组所表达的全部相应的蛋白质，称为蛋白质组。 Proteomics(蛋白质组学)：指应用各种技术手段来研究蛋白质组的一门新兴学科，即研究细胞在不同生理或病理条件下蛋白质表达的异同，对相关蛋白质进行分类和鉴定。更重要的是蛋白质组学的研究要分析蛋白质间相互作用和蛋白质的功能. 2…. Mass Spectrometer（质谱仪）：质谱仪是一个用来测量单个分子质量的仪器，但实际上质谱仪提供的是分子的质量与电荷比（m/z or m/e）。分离和检测不同同位素的仪器。即根据带电粒子在电磁场中能够偏转的原理，按物质原子、分子或分子碎片的质量差异进行分离和检测物质组成的一类仪器。质谱仪最重要的应用是分离同位素并测定它们的原子质量及相对丰度。 separation and identification methods（3）different samples,different extraction.蛋白质样品制备是蛋白质组研究的第一步肽链合成的结束，并不一定意味着具有正常生理功能的蛋白质分子已经生成。已知很多蛋白质在肽链合成后还需经过一定的加工（processing）或修饰，由几条肽链构成的蛋白质和带有辅基的蛋白质，其各个亚单位必须互相聚合才能成为完整的蛋白质分子。 unknow peptide从头测序为蛋白质组研究提供了一种不用借助于任何蛋白质序列数据库信息直接解读串联质谱数据的方法其基本算法主要由4个部分组成质谱图的构建离子类型的确定测序算法以及打分算法 6.Tandem mass spectrometry(串联质谱) 串联质谱法是指用质谱作质量分离的质谱方法。它还有几种名称，如质谱-质谱法、多级质谱法、二维质谱法和序贯质谱法。 作用：1、诱导第一级质谱产生的分子离子裂解，有利于研究子离子和母离子的关系，进而给出该分子离子的结构信息。 2、从干扰严重的质谱中抽取有用数据，大大提高质谱检测的选择性，从而能够测定混合物中的痕量物质。 peptide molecular weight肽指纹图谱，PMF，peptide mapping fingerprint,蛋白酶解后产生多个肽片断，然后利用质谱（通常用MALDI－TOF）测量这些肽段的分子量，然后上网进行蛋白谱库搜索，以确认此蛋白是何种蛋白，此为PMF。这些肽段就像蛋白的指纹一样，有了这些肽段，就可以确认蛋白了→(A+)*→B++C++D+ 9.Peptide sequence tag 肽序列标签：将蛋白质进行酶切降解 做电喷雾质谱产生包括多电荷峰在内的肽质量指纹谱，选择有一定丰度的双电荷峰经气体碰撞活化池碰撞后产生碎片，其中包含着结构信息，由这些信息可以推出蛋白质的某一肽段的部分氨基酸序列测定出的部分氨基酸序列和其序列两段的质量称为肽序列标签。 10. Post-source decay(源后衰变)：发生在离子源后的第一个无场区域，时间跨度为微秒；由于发生在无场区域，所以产生的不同片段离子和母离子保持同样速度，用离子镜反射，将片段离子和母离子分离，按质量大小排列可形成离子谱，称为PSD谱 11. Phage display technology（噬菌体展示技术）：To allow the presentation of large peptideand protein libraries on the surface of filamentous phage,which leads to the selection of peptides and proteins。噬菌体展示技术是一种基因表达产物和亲和选择相结合的技术，他以改构的噬菌体为载体，把待选基因片段定向插入噬菌体外壳蛋白质基因区，使外源多肽或蛋白质表达并展示于噬菌体表面，进而通过亲和富集法表达有特异肽或蛋白质的噬菌体 12.Neutral loss scan 中性丢失扫描：中性丢失扫描是三重四极杆串联质谱仪所独有的数据采集方式之一,它的主要工作原理是一级质谱(MS1)和二级质谱(MS2)同时扫描,而MS2与MS1始终保持质量差Δm,最终的图谱将显示那些来自一级谱图中通过裂解丢失中性碎片(Δm)的离子。 13. Structural biology（结构生物学）：is a branch of molecular biology, biochemistry, and biophysics concerned with the molecular structure of biological macromolecules, especially proteins and nucleic acids, how they acquire the stru