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WGA扩增操作原理步骤介绍
什么是WGA
全基因组扩增(whole genome amplification,WGA)
是一组对全部基因组序列进行非选择性扩增的技术,其
目的是在没有序列倾向性的前提下大幅度增加DNA的总量。
为什么WGA
法医
科研 考古
单细胞水
平,微量
DNA
临床诊 微生物,
断 环境
为什么WGA
DNA测序,
文库制备
目标DNA富
Micro-
集,探针制
备 array
WGA产物
RFLP或 PCR,
SSCP 基因克隆
WGA在PGD中的应用
胚胎活检
IVF
全基因组扩增
PCR/qPCR 高通量测序 SNP芯片/arrayCGH
WGA类型
以PCR为基础的WGA:
简并寡核苷酸引物PCR (DOP-PCR)
连接反应介导的PCR (LM-PCR)
扩增前引物延伸反应(PEP-PCR)
以等温扩增为基础的WGA:
多重链置换扩增(MDA)
基于引物酶的全基因组扩增(pWGA)
多次退火环状循环扩增技术(MALBAC)
DOP-PCR
Degenerate oligonucleotide primer- PCR
简并寡核苷酸引物:
引物结构:
5’端约10nt序列— PCR引物结合
N6简并序列
— 随机结合模板
3’端约6nt序列
Rubicon Genomics Inc. —— PicoPlex kit
Sigma Aldrich Inc. —— GenomePlex kit OmniPlex文库技术
BlueGnome Inc. —— SurePlex kit
Sigma Aldrich为例 DOP-PCR
单细胞裂解和
gDNA打断 OmniPlex文库:
基因组随机片断化,
形成一系列短且重叠
的
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