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ShiJie 第二届中国水禽发展大会 研究报道
ShuiQin
杭州地区四种野鸭
的分子遗传多样性研究
章学东1,张伟武1,严冰2,韩水永3,楼立峰1,范京辉1,周佳捷2,李慧芳4
(1.杭州市农业科学研究院,浙江杭州310024;2.杭州市农业局,浙江杭州310002;
3.萧山区农业局,浙江萧山311203;4.中国农业科学院家禽研究所,江苏扬州225003)
摘要:为揭示杭州地区野鸭遗传多样性的现状,以利于进一步开展保护、开发和利用。本研究运用8个
微卫星标记对地区内媒头鸭、斑嘴鸭、钱江野鸭和西湖野鸭等4种野鸭进行了分子遗传学检测,结果表明:8个
度多态外,其余座位均为高度多态;4种野鸭的平均期望杂合度以西湖野鸭最高(0.5971),斑嘴鸭最低
有效的遗传标记用于野鸭遗传结构分析,4种野鸭群体的遗传多样性较为丰富。
关键词:微卫星标记;野鸭;遗传多样性
杭州地区位于浙江省西北部,东临杭州湾,境内水网密布,气候温和湿润,适宜于水禽栖居。我市群众在
长期的生产实践中,将野鸭经过驯养、繁育,形成了数个地方种和培育种,成为本地区水禽养殖的一大亮色。
20世纪90年代以来,微卫星作为评估动物遗传多样性的理想分子标记,在畜禽遗传资源研究中得到广泛应
用,起到了了解品种遗传结构、分析进化历史以及指导育种和生产的重要作用。目前国内外利用微卫星标记
记对杭州地区媒头鸭、斑嘴鸭、钱江野鸭和西湖野鸭等4种野鸭进行了分子遗传学检测。通过揭示其遗传多样
性的现状,为本地区野鸭品种的进一步保护、开发和利用提供参考依据。
1材料与方法
1.1试验材料
1.1.1血样 。
沙经济技术开发区,每种野鸭各取10公20母共30个血样。
1.1.2引物
有限公司合成(见表1)。
研究梆U茸 第二届中国水禽发展大会 水禽世界
表1 8对微卫星引物序列特征及退火温度
1.I.3主要仪器设备
PCR扩增仪:Eppendorf
LCS
NO.00086.美国。
1.1.4主要试剂
试验所用Taq IMarkers作为分子
DNA聚合酶和dNTPs均购自上海生工生物公司,采用pBR322DNA/Msp
量的标准对照。
1.2试验方法
1.2.1采血
.
每只鸭跖静脉采血1.5~2ml,加入盛有7~8ml70%无水乙醇的离心管中,混匀后置于一200C冷冻保存。
1.2.2血液基因组DNA的提取
参照文献【111并稍加改进,对基因组DNA进行OD值测定,调整DNA终浓度至50Ilg,斗l。
1.2.3 PCR扩增
mmol/L mmol/L DNA
dNTPs、5
PCR.反应体系25山,包括10xbuffer2.5山、2.5M[矿、0.2 pmol/L引物、1UTaq
DNA模板。扩增反应程序为:95。C预变性4min;94。C3睢508,55—58。CN火50s,72。Ct垂伸lmin,
聚合酶、50Ilg
30.35个循环;最终72℃延伸5min。
1.2.4产物检测
扩增产物在IxTBE缓冲液、8%非变性聚丙烯酰胺凝胶中电泳后,用银染法染色,成像系统拍照,根据
Markers判断扩增片段大小。
1.2.5数据统计与处理
1000个重复抽样数得到。
2结果
2.1微卫星座位的遗传特性
8个微卫星座位在杭州地区4种野鸭内的平均遗传变异参数见表2。由表2可见,试验共检测到35
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