基于ndhF序列植物遗传关系分析.doc

SHANDONGＵＮＩＶＥＲＳＩＴＹ　ＯＦ　ＴＥＣＨＮＯＬＯＧＹ 毕业论文 基于ndhF序列的植物遗传关系分析 学 院： 生命科学学院 专 业： 生物技术 学生姓名： 王维龙 学 号： 0812107614 指导教师： 张建勇 20 12 年 6 月 中文摘要 随着分子生物学和生物信息学的快速发展, 基于各种分子数据的分析已成为植物系统学研究的主要手段, 其中以DNA序列的比较分析应用最为广泛。植物拥有3套基因组, 按进化速率由快到慢依次为核基因组( nDNA) 、叶绿体基因组( cpDNA) 和线粒体基因组(mtDNA) (Wolfe et al. , 1987) 。每套基因组内不同区域的核苷酸进化速率不同, 为各分类阶元的系统学研究提供了丰富的变异来源。 ndhF是叶绿体功能基因，该基因共含有21个编辑位点, 且这21个位点均为部分编辑。生物信息学分析及与其它物种比对结果表明, ndhF C290位编辑可能会影响该蛋白的正确折叠。进一步使用单克隆酶切方法测定了不同胁迫处理对ndhF C290位编辑效率的影响。 论文基于ndhF序列对几种植物进行了遗传关系分析。首先从GenBank数据库中筛选植物序列，所得序列利用软件进行相关分析，根据遗传距离及分子系