分子动力学方法模拟热致蛋白质构象变异研究论文.pdfVIP

第五届全国环境化学大会（2009） 分子动力学方法模拟热致蛋白质构象变异研究 曹同成 肖苏林 赵国华* （同济大学化学系，上海，200092；联系人，E-mail ：g.zhao@tongji.edu.cn ） 各种物理场作用下诱发的各种环境污染问题日益突出，例如由于全球变暖问 题引起科学家对温度升高导致生物体以及蛋白质、酶等生物大分子发生各种变化 的研究越来越受到重视。本文利用分子动力学方法对水溶液中耐热性蛋白和不耐 热蛋白进行了模拟微波加热升温过程的计算。利用 Gromacs 3.3 软件对钙调蛋白 和血红蛋白进行了从 27 ℃开始升温过程的模拟计算，探讨模拟微波辐射和热场作 用下蛋白质构象变化，以得到蛋白质在升温过程中构象变异乃至失活的整个过 程，并对耐热性蛋白和不耐热性蛋白构象变异进行了对比研究。计算结果表明， 在模拟升温过程中：钙调蛋白与 Ca2+ 结合后相当稳定，并且耐热性良好，在 70℃ 以下蛋白质分子结构基本无明显变化；而血红蛋白的耐热性能并不是太好，从 40 ℃开始蛋白质分子的整体结构便开始向松散式构象转化，随着温度的升高，