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中国农业科学 2011,44(5):1015-1021
Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2011.05.019
奶牛瘤胃微生物BAC文库中ACCase基因的筛选
与生物信息学分析
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赵圣国 ，王加启 ，卜登攀 ，刘开朗 ，朱雅新 ，周凌云
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( 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所/动物营养学国家重点实验室，北京 100193 ；中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室，
北京 100080 ）
摘要：【目的】从奶牛瘤胃微生物 BAC 文库中筛选含乙酰 CoA 羧化酶（ACCase）基因的克隆子，并对其全长
测序和生物信息学分析。【方法】利用 PCR 序列驱动筛选法，从瘤胃微生物 BAC 文库中筛选 ACCase 基因，鸟枪法
测定基因序列后，进行基因注释、比对和系统发育分析。【结果】筛选得到了含 ACCase 基因的克隆（U12），其插
入片段序列（URE12）全长 43 358 bp，GC 含量为 43.75%，经 GeneMark 程序预测含有 38 个基因，经 Signature
程序预测属于变形菌门。ACCase基因（Acc-32 ）编码159 个氨基酸，与Elusimicrobium minutum 的ACCase基因
具有 41%的相似度，编码蛋白分子量为 17.89 kD，等电点为 5.27，在距离 Acc-32 上游的 33 kb 区域，发现一段
能编码ACCase 连接酶的基因。Acc-32 的结合位点氨基酸残基为GQVICVIEAMKVFNELKA，系统发育分析表明 Acc-32
属于ε-变形菌纲。【结论】得到了含有ACCase基因的序列片段，并且ACCase基因具有新的结构特征。
关键词：瘤胃微生物；BAC文库；乙酰CoA 羧化酶；基因注释；生物信息学
Screening and Bioinformatics Analysis of ACCase
BAC Library of Dairy Cow Rumen Microbiota
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ZHAO Sheng-guo , WANG Jia-qi , BU Deng-pan , LIU Kai-lang , ZHU Ya-xin , ZHOU Ling-yun
1
( Institute of Animal Science, Chinese Academy of Agricultural Sciences /Key Laboratory of Animal Nutrition, Beijing 100193;
2Institute of Microbiology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100080)
Abstract: 【Objective 】 The objective of the experiment is to screen, sequence and bioinformatical analyze the ACCase clone
from a BAC library of the dairy cow rumen mi
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