ISSR分子标记及其在植物研究中的应用.pdfVIP

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维普资讯 分子植物育种,2007年,第5卷,第6(S)期,第 123—129页 MolecularPlantBreeding,2007,Vo1.5,No.6(S),123—129 专题介绍 Review ISSR分子标记及其在植物研究中的应用 赵谦 - 杜虹 1庄东红 1,2 1汕头大学生物系,汕头,515063;2韩山师范学院生物系,潮州,521041 通讯作者,dhzhuang@stu.edu.cn 摘 要 ISSR(intersimplesequencerepeat)分子标记是一种以微卫星序列为引物,进行多位点PCR扩增的 技术。ISSR技术简易、快捷,同时兼备AFLP(扩增酶切片段多态性)、SSR(简单序列重复)和RAPD(DNA随 机扩增多态性)等分子标记方法的优点。引物设计无需预知基因组序列,只要是 目标区域的长度在可扩增范 围内,就能扩增出微卫星重复序列间的DNA片段。ISSR标记以其高多态性,已被广泛应用于种质收集、品种 鉴定、遗传多样性、系统进化关系、遗传作图、基因定位、标记辅助选择、预测基因组 SSR基序的丰度 以及 SSR引物开发等研究。本文对 ISSR技术及其在植物研究中的应用进行全面的概述。 关键词 ISSR,分子标记,种质鉴定,遗传多样性 ISSRM olecularMarkeranditsApplicationinPlantResearch ZhaoQian DuHong ZhuangDonghong 1DepartmentofBiology,ShantouUniversity,Shantou,515063;2DepartmnetofBiology,HanshanNormalUniversity,Chaozhou,52140 1 Correspondingauthor,dhzhuang@stu.edu.cn Abstract ISSR (intersmiplesequencerepeat),isakindofDNAmolecularmrakers,whichmightgeneratethe multipleloci,ItisalsoasmipleandrapidapproachthathashteadvnatagesofAFLP (amplifiedfragmentlength polymorphism),SSR(smiplesequencerepeat)nadRAPD(rnadomlymaplifiedpolymorphismDNA).ISSRprimer wouldbeeasilydesignedwihtoutnaybackgroundniformationofgenomicsequences,nadhtetargetedDNA fi~ag- mentcouldbema plifiedifonlyhtemaplifiabledistanceisavailable.ISSRmrakerswouldbewellknownashihg polymorphismshtatwidelyusednihtefieldsofgermplasmcollection,cultivraidentification,geneticdiversity, phylogneeticnaalysis,geneticmappnig,geneatgging,mrakerassistedselection,determniationofSSR motif五re- quencyna ddevelopmne tofSSR primers.Thispaperwewouldliketoprovidehteoverviewsofthistechnology naditsapplicationni plna treserachnaddevelopment. Keywords ISSR,Moleculramraker,Gemr plasm identification,Geneticdiversiyt 自从 20世纪 80年代中期PCR技术的出现,使 性。RAPD技术由于引物是随机序列,所以操作十分 得涌现出一大批基于PCR的分子标记技术,这些技 简单快速经济,但可重复性不够理想。AFLP技术的 术简便快捷,而且只需少量的DNA即可。新的分子 多态性和重复性都不错,但对实验器材和技术要求 标记技术已经在很多研究领域体现出它的优势,尤 稍高,因此较为复杂和花费更多。SSR技术拥有高度 其是遗传多样性和基因图谱构建。其中运用最广泛 特异性和丰富多态性并且为共显性标记 ,但它需要 的三种技术分别是DNA随机扩增多态性(randomly 预先知道基因组的序列

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