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用高效液相色谱法对真核细胞脱氧核糖核酸中碱基含量的研究.pdf
用高效液相色谱 法对真核细胞
脱氧核糖核酸 中碱基含量的研 究*
都恒华 吕慧梅 郑庆泉* 焦中华*
南(京大学化学系) 南(京大学生物系)
[提要] 本文提出了一个快速定量测定脱氧核糖核酸DNA)水解产物中各碱基含量的高
效液相色谱法。在HypersilODS柱上,用06M醋酸钠,4 甲醇PH7作洗脱液,可将胞 嘧
啶 C 、尿嘧啶 U 、鸟嘌呤 G 胸腺嘧啶T 腺嘌呤A五种碱基基线分离。方法简
便,12分钟可完成分离,取样量0.3 克或更少,最低检出极限约5毫微克3(0pmole,标准
偏差在0.1 0.8。对中、幼年小白鼠全脑,小牛胸腺,鱼精DNA中的碱基进行了测定,结果
与文献值基本一致。
DNA的碱基组成具有种的特异性,即 啶,胸腺嘧啶 T,尿嘧啶 均(为上海试剂
不同生物种的DNA具有自已独特的碱基组 二厂产品);鸟嘌呤、鱼精 DNA 上(海东
成。因此测定DNA的碱基组成不仅可以用 海制药厂),以上均为98 ;小牛胸腺DNA
作生物分类的指标、阐明生物之间亲缘关系, 上(海牛奶公司)。其它试剂均为分析纯。
而且对研究DNA的结构也具有重要意义。 甲醇重蒸馏一次。水为亚沸蒸馏器重蒸馏
DNA中各种碱基的测定方法有薄层层 水。流动相和样品溶液均经0.5μ蘭m滤膜过滤。
析法[1],纸层析法[2],热变性温度法[3,浮 等摩尔A,G,C,T,U混合溶液的配制:
力密度法[4]等。随着高效液相色谱 HPLC) 用0.1毫克/毫升的碱基储备溶液配成各碱基
的发展,Horvath等[5]用薄壳型离子交换树 浓度约为1.7×10-4M的溶液 用(氢氧化钠调
脂分离了鸟嘌呤 G 腺嘌呤A 胞嘧啶 节pH为4)当天配制。各种DNA水解方法按
C)和尿嘧啶U)四种碱基。KO等[s]用阳离 文献[11]。取 1毫克试样,最后稀释为2.5毫
子交换树脂测定了微生物DNA中G(+C)的 升。
摩尔百分含量。Ehrlich等[7]和 Hoffman 二()小白鼠全脑 DNA 的提取与纯化
等[8]用反相离子对色谱法分离碱基。潘星时 昆明种小白鼠由本校动物房提供,幼年
等[9]用HPLC梯度洗脱法对细菌DNA中的 小白鼠 ( 30天)和中年小白鼠 (,一
G+C)含量进行了测定。本文用HPLC法 年),每批各50只。取其全脑,按文献[10]
分离和测定了小白鼠全脑、小牛胸腺和鱼精 报道的方法提取,纯化DNA。产品的紫外
DNA中的碱基,方法灵敏,快速,重现性好。 吸收A260/A280在1.80~?1.90,表示不含蛋白
及DNA。DNA的 λ极大在260nm, 极小在
实 验 部 分 230nm左右,符合其特征吸收。用琼脂糖凝
一()仪器与试剂 胶电泳检查其纯度,仅DNA一个斑点。
高效液相色谱仪,日本岛津 LC-4A, (三)分析方法
SPD-1分光光度检测器,C-R2A数据微处
理机,R-112M记录仪。 *中国科学院科学基金资助的课题。本校生物系毕业
生郭联庆参加部分工作。
腺嘌呤 上(海生化研究所);胞嘧 *为化学系毕业生。
标准碱基溶液 各(碱基含量约为100ng/
5μ)的色谱图如图1所示。用校正面积归
一化法测定各碱基的相对摩尔百分含量。先
以等摩尔标准碱基注入柱内,得色谱图,根
据各碱基量与峰面积的比率计算得各碱基的
校正因子。然后注入样品溶液,从分离所得
碱基的峰面积乘以校正因子即得各碱基的含
量。根据C,G,T,A的总量,计算其中 G(+
C)的摩尔百分含量。
时间较长。加甲醇至4%时,各组分的保留
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