利用菌落PCR—DGGE快速鉴定盐渍土壤菌种多样性.pdfVIP

维普资讯 第 l9卷 第4期 塔 里 术 大 学 学 报 VoI_l9No．4 2007年 l2月 JournalofTarim University Dec．2oo7 文章编号：1009—0568(2007)04—0030—03 利用菌落PCR—DGGE快速鉴定 盐渍土壤菌种多样性 张海燕 贺江舟 龚明福 刘 占文 张利莉 (新疆生产建设兵团塔里木盆地生物资源保护利用重点实验室，新疆 阿拉尔 843300) 摘要 利用菌落PCR方法，结合DGGE的检测方法，对所保存的87份盐生菌的培养物进行了多样性检测 ，初步研究显示至少 有31株不同的菌种，表明新疆盐生环境存在较为丰富的菌种资源，同时表明菌落PCR结合 DGGE技术为细菌鉴定和菌种保 藏过程中重复菌株的去除提供了一种快速可靠的手段。 关键词 菌落PCR；DGGE；多样性；菌种保存 中图分类号：Q93 文献标识码：A BasedonBacterialColonyPCR—DGGE forRapid DeterminationofMicrobialDiversityinXinjiangSalt——soil ZhangHaiyan HeJiangzhou GongMingfu LiuZhanwen ZhangLili (KeyLaboratoryofProtection UtilizationofBiologicalResourcesinTafimBasinof Xi~iangProductionandConstructionGroups，TafimUniversity，Alar，Xi~iang，843300) Abstract Inthispaper，thecombinationofbacterialcolonyPCR anddenaturinggradientelectrophoresiswereusedinthemicrobial diversityanalysisof87haloinhabitedbacterialculturecollections．Theresultsshowedtherecovered87culturecollectionscontainat least31differentstrains，whichconfirmedthatthecombinationofcolonyPCRandDGGE isareliableandtime—conservedapproachto eliminatetherepetitivestrainsinbacterialidentificationandstrainconservation．Theresultsshowedtherewasrgeatmicrobialdiversity insalt—soilinXinjiang． Keywords bacterial colonyPCR；DGGE；diversity；strainconservation 极端环境微生物因其具有特殊的基因类型、生 生菌研究的基础。在菌株的鉴定和保存过程中，既 理机能和代谢产物，潜藏极大的科学和应用价值而 要尽可能的保留所有分离到的可培养菌种，又要避 成为世界生物学研究的热点之一。新疆南疆地域辽 免重复，减少工作量。在实际工作中，常用传统的分 阔气候独特，土壤盐碱化，干旱程度严重，夏季温度 离培养的方法研究环境微生物多样性，这些方法对 较高，其 中蕴藏丰富多样的极端环境微生物、次极端 微生物的研究只停留在微生物的培养特征、菌落形 环境微生物主要为耐高温微生物、耐干旱微生物