基于对象代理数据库的微生物信息服务系统.pdfVIP

第30卷第 1期 计算机应用 Vo1．30No．1 2010年 1月 JournalofComputerApplications Jan．2010 文章编号：1001—9081(2010)01—0005—05 基于对象代理数据库的微生物信息服务系统 彭智勇 ，黄泽谦 ，刘 俊 ，李 越 ，徐 波 (1．武汉大学 计算机学院，武汉 430072；2．武汉大学 软件工程国家重点实验室，武汉 430072) (peng@whu．edu．al1) 摘 要：提出了一种采用对象代理数据库实现微生物数据管理的新方法。该方法将微生物菌种资源数据的共性 描述信息定义为基本微生物对象，其代理对象可以用来表示微生物菌种资源分类的多样性，并定义不同菌种的特性 性状信息，也可以用来定义微生物资源不同类别的扩展关联信息；通过对象更新迁移可以支持数据动态分类，利用对 象视图机制可以支持模式演化，跨类查询机制则实现 了高效的数据检索；实现了一个基于对象代理数据库的微生物 信息服务系统。实验测试表明，该方法比传统方法更有效。 关键词：微生物信息服务系统；对象代理模型；对象代理数据库 中图分类号：TP311 文献标志码：A Microbiologyinformationservicesystembasedonobjectdeputydatabase PENG Zhi—yong，HUANG Ze—qian ，LIU Jun ，LIYue，XUBo (1．SchoolofComputer,WuhanUniversity,WuhanHubei430072，China； 2．StateKeyLaboratoryofSoftwareEngineering，WuhanUniversity,WuhanHubei430072，China) Abstract：Anewapproachformicrobiologyinformationmanagementbasedonobjectdeputydatabasewasproposed．It usedtheobjectdeputymodelofrdatamodeling．Thecommondescriptiveinfomrationofmicrobeswasdefinedasthebasic object．Microbialdiversityandcorrelated informationofmicrobesweremodeledthroughdeputyobjects．Amicrobiology informationservicesystembasedonourobjectdeputydatabasewasimplemented．Advancedfunctionsofthedatabasecould facilitateinfomrationmanagement．Updatepropagationsuppo~sdynamicclassificationofdata，objectviewscouldbeusedfor schemaevolution，andcross—classqueryprovidesefficientdataretrieva1．Theexperimental resultshowsthatthisapproach outperfomr sthetraditionalones． Keywords：microbioloyg infomrationservicesystem；objectdeputymodel；objectdeputydatabase 领域 占据了重要的地位 ，许多生物数据库都是建立在关系数 0 引言 据库基础之上，然而大量的研究已