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基于ITS序列探讨西瓜种下分化.pdf
中国麈亏通报 2010,26(01):17-21
ChineseAgriculturalScienceBulletin
基于ITS序列探讨西瓜种下分化
周先治 ,陈 晟 ’,吴宇芬 ,陈 阳 ,赵依杰
(福建省农科院农业生物资源研究所,福州350003;福州市农业科学研究所,福州350018)
摘 要:【研究目的】对源自中国和非洲的15个西瓜Citrulluslanatus的核糖体基因内转录间隔区(in-
ternaltranscribedspacers,ITS)全序列进行比较分析。供试材料包括Mucosospermus亚种、Vulgaris
亚种、源 自中国的3个品种、源 自加纳的3个品种和1个来自布基纳法索的品种。【结果】西瓜种 内总
变异位点27个,占总碱基数的5.93%,6个信息位点,占总碱基数的1.32%。不同品种西瓜的ITS序列
全长455~473bp,G+C含量61.49%~63.41%。【结论】从ITS序列全长构建的系统树可以看出西瓜具
有地理分化现象,中国西瓜和非洲西瓜分属不同分支。此研究对西瓜的引种、育种以及研究西瓜的
地理演化都具有一定的指导意义。
关键词 :西瓜 ;核糖体 ;内转录间隔区;种下分化
中图分类号:S321 文献标识码 :A 论文编号:2009—1575
IntraspeeiesRelationshipsinCitrulluslanatusInferedfrom ITSSequenceData
ZhouXianzhi,ChenSheng,WuYufen,ChenYang,ZhaoYijie
(AgriculturalBio—resourcesResearchInstitute,F~ianAcademyofAgriculturalSciences,Fuzhou350003;
。FuzhouInstituteofAgriculturalSciences,Fuzhou350018)
Abstract:[OBJECTIVE]AphylogenyofthesubspeciesinCitrulluslanatus,whichcomprisessubsp.
Muc0s0spermus,subsp.Vulgaris,3 cultivatorsfrom China,3 cultivatorsrfom.Ghanaand onerfom
BurkinaFaso、wasreconstructedbasedonthenueleotidesequencesofITSregionsofrDNA.Toeluci-
daterelationshipsamong intraspeciesin Citrulluslanatus.And toassessthebiogeographyofthespe—
ties.[RESULTS]Phylogeneticanalysesindicatedthattherewere27variable siteswhichwere5.93%
ofentiresequenceand6informativesiteswhiehwerel-32% oftotalsequenceinCitruHuslanatus.The
lengthrangeofITSsequnceinCitruHuslanatuswasrfom 455to473bp,thepercentageofG +Ccon—
tentvariedfrom61.49% to63.41%.【C0NCLUSION】Topol0gyobtainedfortheITSdatarevealedthat
geographicaldifferentiation in CitruHuslanatusfrom ChinaandArfica.Analysisoftheinternaltran—
scribedspacersequencesisagoodtooltodiscriminatesubspeciesinCitrulluslanatusandwasuseful
inCitrullus
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